Blocking of gene expression in eukaryotic cells

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 15/11 (2006.01) A61K 31/7088 (2006.01) A61K 31/713 (2006.01) A61P 35/00 (2006.01)

Patent

CA 2667756

The present invention provides methods for designing a sequence for efficient short interference RNA molecules. In particular, the present invention defines a universal target for siRNA derived from a poly A sequence, optionally in conjunction with unique sequences for gene silencing and inhibition of viral replication in a eukaryotic host cell. The present invention further provides methods for the treatment and prevention of diseases and disorders by silencing a gene of a virus, an oncogene, genes encoding transcription factors and many other diseases related genes. The present invention describes antisense nucleic acids compositions comprising sequences complementary to a target nucleic acid. The antisense sequences are designed to hybridize to complementary nucleic acid target regions in a target RNA, and inhibit translation, processing, transport, or binding by proteins or riboproteins. Target regions include, and are limited to a poly-A tail, and exclude, AUG, 5' non-translated sequences, translation initiation factor binding sites, ribosome subunit binding sites, Shine Dalgarno sequence, 3' nontranslated sequences, poly- addition site, 3' cleavage site, coding region, intron, intron branch site, intron/exon junction, and splice sequence.

L'invention concerne un procédé de conception d'une séquence permettant l'obtention de molécules efficaces de petits ARN interférents (siARN). En particulier, l'invention définit une cible universelle pour le siARN dérivé d'une séquence poly A, optionnellement en association à des séquences uniques pour le silençage de gènes et l'inhibition de la réplication virale dans une cellule hôte eukariote. L'invention concerne en outre des procédés de traitement et de prévention de maladies et de troubles, par silençage d'un gène d'un virus, d'un ocogène, d'un gène codant des facteurs de transcription et de nombreux autres gènes associés à des maladies. L'invention concerne en outre des compositions d'acides nucléiques anti-sens comprenant des séquences complémentaires de l'acide nucléique cible. Les séquences anti-sens sont conçues pour s'hybrider aux régions cibles de l'acide nucléique complémentaires dans un ARN cible, pour inhiber la traduction, le traitement, le transport ou la fixation par des protéines ou des riboprotéines. Les régions cibles comprennent, et sont limitées à une queue poly (A), et excluent AUG, des séquences non-traduites en 5', des sites de fixation de facteur d'initiation de traduction, des sites de fixation de sous-unité ribosomique, une séquence de Shine Dalgamo, des séquences non-traduites en 3', un site de poly-addition, un site de clivage 3', une région codante, un site intron, une ramification d'intron, une jonction intro/exon ou une séquence d'épissage.

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