C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) B01L 3/00 (2006.01) C12Q 1/04 (2006.01) C12Q 1/24 (2006.01) C12Q 1/28 (2006.01) G01N 1/28 (2006.01) G01N 1/31 (2006.01) G01N 1/36 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01) G01N 33/574 (2006.01) G02B 21/34 (2006.01) G01N 1/08 (2006.01)
Patent
CA 2318789
A method is disclosed for rapid molecular profiling of tissue or other cellular specimens by placing a donor specimen in an assigned location in a recipient array, providing copies of the array, and performing a different biological analysis of each copy. In one embodiment, the copies of the array are formed by placing elongated specimens in a three dimensional matrix, and cutting sections from the matrix to form multiple copies of a two dimensional array that can then be subjected to the different biological analyses. Alternatively, the array can be formed from cell suspensions such that identical multiple copies of an array are formed, in which corresponding positions in the copies of the array have samples from the same or similar specimen. The results of the different biological analyses are compared to determine if there are correlations between the results of the different biological analyses at each assigned location. In some embodiments, the specimens may be tissue specimens from different tumors, which are subjected to multiple parallel molecular (including genetic and immunological) analyses. The results of the parallel analyses are then used to detect common molecular characteristics of the tumor type, which can subsequently be used in the diagnosis or treatment of the disease. The biological characteristics of the tissue can be correlated with clinical or other information, to detect characteristics associated with the tissue, such as susceptibility or resistance to particular types of drug treatment. Other examples of suitable tissues which can be placed in the matrix include tissue from transgenic or model organisms, or cellular suspensions (such as cytological preparations or specimens of liquid malignancies or cell lines).
L'invention concerne un procédé de définition de profil moléculaire rapide de tissus ou d'autres prélèvements cellulaires, le procédé consistant à placer un prélèvement donneur à un emplacement attribué dans un arrangement récepteur, à réaliser des copies de l'arrangement et à effectuer une analyse biologique différente de chaque copie. Dans un mode de réalisation, on forme les copies de l'arrangement en plaçant des prélèvements allongés dans une matrice tridimensionnelle, puis en coupant des sections de la matrice pour former plusieurs copies d'un arrangement bidimensionnel qui peuvent alors être soumises aux différentes analyses biologiques. Dans un autre mode de réalisation, on peut former l'arrangement avec des suspensions cellulaires de manière à former plusieurs copies identiques d'un arrangement, les positions correspondantes dans les copies d'arrangements contenant des échantillons provenant du même prélèvement ou d'un prélèvement similaire. On compare les résultats des différentes analyses biologiques pour déterminer s'il existe des corrélations entre les résultats des différentes analyses biologiques à chaque emplacement attribué. Dans certains modes de réalisation, les prélèvements peuvent être des prélèvements de tissus sur différentes tumeurs qui sont soumis à plusieurs analyses parallèles moléculaires (y compris des analyses génétiques et immunologiques). On utilise alors les résultats des analyses parallèles pour détecter des caractéristiques moléculaires communes du type de tumeur, et on peut par conséquent les utiliser dans le diagnostic ou le traitement de la maladie. On peut mettre en corrélation les caractéristiques biologiques du tissu avec des informations cliniques ou autres, afin de détecter des caractéristiques associées au tissu, telles que la sensibilité ou la résistance à des types particuliers de traitement médicamenteux. Les tissus provenant d'organismes transgéniques ou modèles ou les suspensions cellulaires (telles que les préparations cytologiques ou les prélèvements d'affections malignes liquides ou les lignées cellulaires) représentent d'autres exemples de tissus appropriés pour être placés dans la matrice.
Kallioniemi Olli
Kononen Juha
Sauter Guido
Kanton Basel-Stadt
Smart & Biggar
The United States Of America As Represented By The Secretary Dep
LandOfFree
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