C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2287496
Provided is a method for characterising cDNA, which method comprises: (a) exposing a sample comprising a population of one or more cDNAs or fragments thereof to a cleavage agent which recognises a predetermined sequence and cuts at a reference site at a known displacement from the predetermined sequence proximal to an end of each cDNA or fragment thereof so as to generate a population of terminal fragments; (b) ligating to each reference site an adaptor oligonucleotide which comprises a recognition site for a sampling cleavage agent; (c) exposing the population of terminal fragments to a sampling cleavage agent which binds to the recognition site and cuts at a sampling site of known displacement from the recognition site so as to generate in each terminal fragment a sticky end sequence of a predetermined length of up to 6 bases, and of unknown sequence; (d) separating the population of terminal fragments into sub-populations according to sequence length; and (e) determining each sticky end sequence.
Cette invention concerne un procédé de caractérisation d'ADN qui consiste à: (a) exposer un échantillon contenant une population d'au moins un ADNc ou de fragment(s) de ce(s) dernier(s) à un agent de clivage qui reconnaît une séquence prédéterminée et coupe au niveau d'un site de référence à un déplacement connu par rapport à la séquence prédéterminée à proximité d'une extrémité de chaque ADNc ou de chaque fragment de ce dernier de manière à générer une population de fragments terminaux; (b) lier à chaque site de référence un oligonucléotide adaptateur qui comprend un site de reconnaissance pour un agent de clivage d'échantillon; (c) exposer la population de fragments terminaux à un agent de clivage d'échantillon qui se lie au site de reconnaissance et coupe par rapport au site d'échantillon de déplacement connu par rapport au site de reconnaissance de manière à générer dans chaque fragment terminal une séquence terminale cohésive d'une longueur prédéterminée pouvant compter jusqu'à 6 bases et de séquence inconnue; (d) séparer la population de fragments terminaux en sous-populations en fonction de la longueur de la séquence; et (e) déterminer chaque séquence terminale cohésive.
Schmidt Gunter
Thompson Andrew Hugin
Brax Group Limited
Ridout & Maybee Llp
Xzillion Gmbh & Co. Kg
LandOfFree
Characterising dna does not yet have a rating. At this time, there are no reviews or comments for this patent.
If you have personal experience with Characterising dna, we encourage you to share that experience with our LandOfFree.com community. Your opinion is very important and Characterising dna will most certainly appreciate the feedback.
Profile ID: LFCA-PAI-O-1921311