C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/37 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01) C07K 1/12 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2278556
A method for characterising polypeptides, which comprises: (a) treating a sample comprising a population of one or more polypeptides with a cleavage agent which is known to recognise in polypeptide chains a specific amino acid residue or sequence and to cleave at a cleavage site, whereby the population is cleaved to generate peptide fragments; (b) isolating a population of the peptide fragments which bear at one end a reference terminus comprising either only an C-terminus or only an N-terminus and which bear at the other end the cleavage site proximal to the reference terminus; and (c) determining a signature sequence of at least some of the isolated framents, which signature sequence is the sequence of a predetermined number of amino acid residues running from the cleavage site; wherein the signature sequence and the relative position of the cleavage site to the reference terminus characterise the or each polypeptide.
L'invention concerne un procédé qui permet de caractériser des polypeptides et qui comprend les étapes suivantes: (a) traiter un échantillon, contenant une population d'un ou plusieurs polypeptides, au moyen d'un agent de clivage qui est connu pour son aptitude à reconnaître un résidu ou une séquence spécifique d'aminoacide dans des chaînes polypeptidiques et à couper lesdits polypeptides au niveau d'un site de clivage, la population étant scindée en vue de générer des fragments de peptides; (b) isoler une population de fragments de peptides qui portent, au niveau d'une extrémité, une terminaison de référence comportant, soit uniquement une terminaison C, soit uniquement une terminaison N et qui portent, au niveau de l'autre extrémité, le site de clivage situé à proximité de la terminaison de référence; et (c) déterminer une séquence de signature d'au moins quelques uns des fragments isolés, cette séquence de signature étant la séquence d'un nombre préétabli de résidus d'aminoacide partant du site de clivage; selon ce procédé, la séquence de signature et la position relative du site de clivage au niveau de la terminaison de référence caractérisent le polypeptide ou chacun des polypeptides.
Schmidt Gunter
Thompson Andrew Hugin
Brax Group Limited
Electrophoretics Limited
Ridout & Maybee Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1362315