Chemical ligation dependent probe amplification (clpa)

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2757300

The present invention provides compositions, apparatuses and methods for detecting one or more nucleic acid targets present in a sample. Methods of the invention include utilizing two or more oligonucleotide probes that reversibly bind a target nucleic acid in close proximity to each other and possess complementary reactive ligation moieties. When such probes have bound to the target in the proper orientation, they are able to undergo a spontaneous chemical ligation reaction that yields a ligated oligonucleotide product. In one aspect, the ligation product is of variable length that correlates with a particular target. Following chemical ligation, the probes may be amplified and detected by capillary electrophoresis or microarray analysis.

La présente invention porte sur des compositions, des appareils et des procédés pour détecter un ou plusieurs acides nucléiques cibles présents dans un échantillon. Les procédés de l'invention comprennent l'utilisation de deux sondes oligonucléotidiques ou plus qui se lient de manière réversible à un acide nucléique cible en proximité étroite entre elles et possèdent des fractions de ligature réactives complémentaires. Lorsque de telles sondes se sont liées à la cible dans l'orientation correcte, elles sont capables de subir une réaction de ligature chimique spontanée qui conduit à un produit oligonucléotidique ligaturé. Sous un aspect, le produit de ligature est d'une longueur variable qui se corrèle à une cible particulière. À la suite de la ligature chimique, les sondes peuvent être amplifiées et détectées par électrophorèse capillaire ou analyse sur micropuce.

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