Chimeric binding peptide library screening method

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/12 (2006.01) C07K 14/72 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/577 (2006.01)

Patent

CA 2301826

There is described a method of isolating nucleotide sequences encoding target peptides from DNA libraries using DNA binding proteins to link the peptide to the sequence which encodes it. DNA libraries are prepared from cells encoding the protein of interest, or from synthetic DNA, and inserted into, or adjacent to, a DNA binding protein in an expression vector to create a chimeric fusion protein. Incorporation of the vector DNA into a carrier package, during expression of the chimeric fusion protein, results in the production of a peptide display carrier package (PDCP) displaying the DNA-bound fusion protein on the external surface of the carrier package. Employment of affinity purification techniques results in the PDCP particles containing sequences encoding the desired peptide to be selected and the desired nucleotide sequences obtained therefrom.

L'invention traite d'un procédé permettant d'isoler, à partir de banques d'ADN et grâce des protéines de fixation de l'ADN, des séquences nucléotidiques codant des peptides cibles et ce, dans le but de fixer le peptide à la séquence qui le code. Des banques d'ADN sont préparées à partir de cellules codant la protéine donnée, ou à partir d'ADN synthétique, et introduites dans, ou à proximité, d'une protéine de fixation de l'ADN d'un vecteur d'expression aux fins de créer une protéine hybride chimère. L'incorporation de cet ADN vecteur dans un module porteur au cours de l'expression de ladite protéine hybride chimère provoque la production d'un PDCP (module porteur de peptides) présentant la protéine hybride fixée à l'ADN sur la surface externe du module porteur. Grâce aux techniques de purification par affinité, les particules du PDCP renferment des séquences codant le peptide souhaité devant être sélectionné et les séquences nucléotidiques souhaitées obtenues grâce à ces techniques.

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