Chromatin segmentation

Details Chromatin segmentation Chromatin segmentation

G - Physics

06

T

G06T 7/40 (2006.01) G06K 9/00 (2006.01) G06T 5/00 (2006.01) G06T 5/20 (2006.01)

Patent

CA 2454091

A method of segmenting chromatin particles in a nucleus of a cell by locating regional minima in an image, computing a zone of influence (ZOI) around each regional minimum, and segmenting a single chromatin blob within each ZOI using a region growing procedure. The method can be used as the basis of a method of qualitatively characterizing the distribution of nuclear chromatin by computing features for individual chromatin particles. Chromatin features can be synthesized from the features of individual particles and particle features can be synthesized into nucleus features and slide features. The method is useful for detecting malignancy associated changes and changes during neoplasia. The method may also be used more generally to assess chromatin patterns in living cells during the cell life cycle. This makes it possible to measure alternations in the evolving patterns that result from pathological or environmental influences.

L'invention concerne un procédé de segmentation de particules de chromatine dans un noyau de cellule, qui consiste à repérer des minima régionaux dans une image, à calculer une zone d'influence autour de chaque minimum régional et à segmenter une tache simple de chromatine à l'intérieur de chaque zone d'influence par le biais d'une procédure de croissance de région. Le procédé peut servir de base d'un procédé de caractérisation quantitative de la distribution de chromatine nucléaire par le calcul de caractéristiques pour des particules de chromatine individuelles. On peut synthétiser des caractéristiques de chromatine à partir des caractéristiques particulaires individuelles, ainsi que des caractéristiques particulaires en caractéristiques de noyau et caractéristiques de lame. L'utilité du procédé réside dans le fait qu'il permet de détecter des changements associés à une malignité, ainsi que des changements lors de néoplasie, et qu'il permet, de façon plus générale, d'évaluer des motifs de chromatine dans des cellules vivantes durant le cycle de vie cellulaire. Ainsi, on peut mesurer des modifications dans les motifs d'évolution qui résultent d'influences pathologiques ou environnementales.

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