Chromatographic method for mutation detection using mutation...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/00 (2006.01) C07H 19/04 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/538 (2006.01)

Patent

CA 2298630

A method for analyzing a sample of double stranded DNA to determine the presence of a mutation therein comprises contacting the sample with a mutation site binding reagent, and chromatographically separating and detecting the product. The chromatographic separation can be performed using Matched Ion Polynucleotide Chromatography, size exclusion chromatography, ion exchange chromatography, or reverse phase chromatography. The mutation site binding reagent can be an enzyme or a non-proteinaceous chemical reagent. In one embodiment, a mutation site binding reagent binds to the site of mutation and alters the chromatographic retention time. In another embodiment, a mutation site binding reagent cleaves at the site of mutation, resulting in an increase in the number of fragments.

La présente invention concerne un procédé d'analyse d'un échantillon de double hélice d'ADN de façon à déterminer la présence d'une mutation dans cette double hélice. Ce procédé consiste à mettre l'échantillon en contact avec un réactif se liant au site de mutation, puis à séparer et détecter chromatographiquement le produit. La séparation chromatographique peut se faire par procédé MIPC (Matched Ion Polynucleotide Chromatography), chromatographie à exclusion de taille, chromatographie par échange d'ions, ou chromatographie en phase inverse. Le réactif se liant au site de mutation peut être une enzyme ou un réactif chimique non-protéinique. Selon une réalisation, un réactif se liant au site de mutation vient se lier au site de mutation puis modifie la durée de rétention chromatographique. Selon une autre réalisation, un réactif se liant au site de mutation vient se cliver sur le site de mutation, ce qui se retrouve sous la forme d'une augmentation du nombre de fragments.

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