Chromosomal blocks as markers for traits

Details Chromosomal blocks as markers for traits Chromosomal blocks as markers for traits

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2643593

The present invention provided a method for predicting a phenotype in a bovine animal, the method comprising analysing a nucleic acid sample from said animal for the presence of at least one genetic marker known to reside in an Linkage Disequilibrium (LD) block in any one of bovine chromosomes BTA-I to BTA-29, wherein said LD block is associated with said phenotype. The phenotype may be selected from the group consisting of Australian profit ranking (APR), Australian selection index (ASR), protein yield (PROT), protein percent (PROT%), milk volume (MILK), fat yield (FAT), fat percent (FAT%), breeding value overall type (Overall Type), somatic cell count (SCC), and breeding value cow fertility (Cow Fertility). Also provided is a linkage disequilibrium unit (LDU) map of any one or more of bovine chromosomes BTA-I to BTA-29', wherein said map comprises a plurality of chromosomal regions, and wherein said regions are defined by their co-inheritance across generations substantially as entire linkage disequilibrium (LD) blocks.

La présente invention concerne un procédé destiné à prédire un phénotype chez un animal bovin, le procédé consistant à analyser un échantillon d'acide nucléique dudit animal afin de déterminer la présence d'au moins un marqueur génétique, connu comme résidant dans un bloc de déséquilibre de liaison (DL), dans n'importe lequel des chromosomes bovins BTA-I à BTA-29, ledit block de déséquilibre de liaison étant associé audit phénotype. Le phénotype peut être choisi parmi le groupe constitué par le classement australien APR (Australian Profit Ranking), l'indice de sélection australien ASI (Australian Selection Index), le rendement protéique (PROT), le pourcentage protéique (PROT %), le volume de lait(LAIT), la production de graisses (GRAISSE), le pourcentage de graisse (GRAISSE %), le type global du taux de reproduction (Type Global), le comptage des cellules somatiques (CCS), et la fertilité des vaches en termes de taux de reproduction (Fertilité des Vaches). L'invention concerne également la carte d'une unité de déséquilibre de liaison (UDL) d'un ou plusieurs des chromosomes bovins de type BTA-I à BTA-29', ladite carte contenant une pluralité de régions chromosomiques. Lesdites régions sont définies par leur héritage commun au travers des générations, en grande partie sous la forme de blocs de déséquilibre de liaison (DL) entiers.

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