Co-crystal structure of monoclonal antibody 5c8 and cd154,...

A - Human Necessities – 61 – K

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A61K 39/395 (2006.01) A61K 38/17 (2006.01) A61P 37/00 (2006.01) C07K 14/705 (2006.01) C07K 16/28 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2421055

The present invention relates to compositions and crystals of CD154 (CD40L) in complex with an anti-CD154 antibody. In addition, this invention relates to the high resolution structure of a CD154/anti-CD154 antibody complex as obtained by X-ray crystallography. Specifically, this structure provides binding sites defined by the structure coordinates determined herein. This invention also relates to a computer (machine) comprising a machine-readable data storage medium comprising a data storage material encoded with machine- readable data comprising the structure coordinates provided by this invention. The computer has instructions to process said machine-readable data into a three-dimensional representation of a molecular complex of CD154/anti-CD154 antibody based on the structure coordinates provided by this invention. This invention also relates to methods using the structure coordinates of an CD154/anti-CD154 antibody complex to solve the structure of similar or homologous molecular complexes, as well as methods using the structure coordinates of an CD154/anti-CD154 antibody complexto design chemical entities or compounds, including agonists or antagonists of CD154, that specifically bind CD154 and function as CD40:CD154 binding interruptors, as well as to design variants of monoclonal antibody 5c8, or humanized monoclonal antibody 5c8, or antigen binding fragements thereof, having improved properties (such as increased or decreased binding affinity for CD154). This invention also relates to compositions comprising said chemical entities, compounds or variants of monoclonal antibody 5c8 or humanized monoclonal antibody 5c8. The invention further relates to uses of said chemical entities, compounds or variants of monoclonal antibody 5c8 or humanized monoclonal antibody 5c8 to treat a subject having one or more conditons associated with inappropriate or abnormal CD154 induced activation.

Cette invention se rapporte à des compositions et à des cristaux de CD154 (CD40L) associés en complexe à un anticorps anti-CD154. Cette invention se rapporte à en outre à la structure haute résolution d'un complexe d'anticorps CD154/anti-CD154, tel qu'il est obtenu par cristallographie aux rayons X. Cette structure fournit spécifiquement des sites de liaison définis par les coordonnées de structure déterminés dans cette invention. Cette invention concerne également un ordinateur (machine) comprenant un support de données lisible par machine, comprenant un matériau mémoire de données codé par des données lisibles par machine comprenant les coordonnées de structure fournies par cette invention. Ledit ordinateur possède des instructions lui permettant de traiter lesdites données lisibles par machine en une représentation tridimensionnelle d'un complexe moléculaire d'anticorps CD154/anti-CD154, sur la base des coordonnées de structure fournies par cette invention. Cette invention concerne également des procédés utilisant ces coordonnées de structure d'un complexe d'anticorps CD154/anti-CD154 pour résoudre la structure de complexes moléculaires similaires ou homologues, ainsi que des procédés utilisant les coordonnées de structure d'un complexe d'anticorps CD154/anti-CD154 pour mettre au point des entités chimiques ou des composés, y compris des agonistes ou des antagonistes de CD154, qui se fixent spécifiquement à CD154 et qui servent d'interrupteurs de liaison CD40:CD154, et pour mettre au point des variants de l'anticorps monoclonal 5c8 ou de l'anticorps monoclonal humanisé 5c8, ou de fragments de ceux-ci pour liaison antigénique, lesquels ont des propriétés améliorées (telles qu'une affinité de liaison accrue ou réduite pour CD154). Cette invention concerne également des compositions comprenant ces entités chimiques, ces composés ou ces variants d'anticorps monoclonal 5c8 ou d'anticorps monoclonal humanisé 5c8. Cette invention concerne enfin des utilisations de ces entités chimiques, de ces composés ou de ces variants d'anticorps monoclonal 5c8 ou d'anticorps monoclonal humanisé 5c8, pour traiter un sujet souffrant d'un ou de plusieurs états associés à une activation induite de CD154 inappropriée ou anormale.

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