Comparative genomic hybridization

Details Comparative genomic hybridization Comparative genomic hybridization

C - Chemistry, Metallurgy

40

B

C40B 40/06 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01)

Patent

CA 2521068

The present invention relates to a method of comparing at least one chromosome or part thereof from a cell with a first karyotype with the corresponding chromosome or part thereof from a cell with a second karyotype. The method includes the steps of: (a) amplifying DNA from an isolated chromosome or part of an isolated chromosome; (b) attaching the amplified DNA to a solid substrate; (c) amplifying DNA from one or more cells with a first karyotype and amplifying DNA from one or more cells with a second karyotype; (d) labelling the amplified DNA from the one or more cells with a first karyotype with a first label, and labelling the amplified DNA from the one or more cells with a second karyotype with a second label, wherein the first and second labels are detectably different; (e) hybridizing the amplified and labelled DNA from the one or more cells with a first karyotype to the amplified DNA attached to the solid substrate, and hybridizing the amplified and labelled DNA from the one or more cells with a second karyotype to the amplified DNA attached to the solid substrate; and (f) comparing the relative amount of first and second labels hybridized to the amplified DNA attached to the solid substrate.

La présente invention concerne une méthode de comparaison d'au moins un chromosome ou d'une partie de ce dernier provenant d'une cellule présentant un premier caryotype, avec le chromosome correspondant ou une partie de ce dernier provenant d'une cellule présentant un deuxième caryotype. La méthode comprend les étapes suivantes: (a) on amplifie l'ADN d'un chromosome isolé ou d'une partie d'un chromosome isolé; (b) on fixe l'ADN amplifié sur un substrat solide; (c) on amplifie l'ADN d'au moins une cellule présentant un premier caryotype et on amplifie l'ADN d'au moins une cellule présentant un deuxième caryotype; (d) on marque, avec un premier marqueur, l'ADN amplifié provenant d'au moins une cellule présentant un premier caryotype et avec un deuxième marqueur, l'ADN amplifié provenant d'au moins une cellule présentant un deuxième caryotype, lesdits premier et deuxième marqueurs étant détectables de manière différente; (e) on hybride l'ADN amplifié et marqué provenant d'au moins une cellule présentant un premier caryotype, avec l'ADN amplifié fixé sur le substrat solide et on hybride l'ADN amplifié et marqué provenant d'au moins une cellule présentant un deuxième caryotype, avec l'ADN amplifié fixé sur le substrat solide; et (f) on compare la quantité relative des premier et deuxième marqueurs hybridés à l'ADN amplifié fixé sur le substrat solide.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-1556804