C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
40
B
C40B 30/02 (2006.01) G06F 19/00 (2011.01)
Patent
CA 2477459
The static and electrostatic interaction energy fields between probe atoms and the atoms of a topomerically aligned fragment placed in a three-dimensional grid may be used to derive a CoMFA model. The topomeric CoMFA model coefficients may be used to predict partial activity values for fragments not derived from molecules of the activity series. The partial activities can be summed to provide a predicted activity for all fragment positions of the activity series molecules. A Virtual Library in which topomerically aligned fragments are associated with their respective steric and electrostatic interaction energies can be searched for fragments similar in shape to the fragments derived from the molecules of the activity series. The identified fragments can be used with the topomeric CoMFA coefficients to predict their activity if used in the molecular activity series.
Les champs d'énergie d'interaction stérique et électrostatique, situés entre des atomes d'une sonde et les atomes d'un fragment à alignement topométrique disposé dans une grille tridimensionnelle, peuvent être utilisés pour réaliser un modèle CoMFA. Les coefficients du modèle CoMFA topométrique peuvent être utilisés pour prédire des valeurs d'activités partielles pour des fragments non dérivés de molécules de la série d'activités. Ces activités partielles peuvent être additionnées afin de fournir une activité prédite pour toutes les positions des fragments des molécules de la série d'activités. Une bibliothèque virtuelle, dans laquelle des fragments alignés de façon topométrique sont associés à leur énergie d'interaction stérique et électrostatique respective, peut être consultée afin d'y rechercher des fragments dont la forme est similaire à celle des fragments dérivés des molécules de la série d'activités. Les fragments identifiés peuvent être utilisés avec les coefficients du CoMFA topométrique pour prédire leur activité lorsqu'ils sont utilisés dans la série d'activités moléculaires.
Cramer Richard D.
Jilek Robert J.
Cramer Richard D.
Jilek Robert J.
Kirby Eades Gale Baker
LandOfFree
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