Compositions and methods for analysis of nucleic acid...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01)

Patent

CA 2718011

The present invention provides systems, methods and kits for performing a detection assay (e.g., invasive cleavage assay) in combination with an amplification assay (e.g., PCR), where the detection assay employs enzyme footprint probes with relatively short (e.g., 6-12 bases) analyte-specific regions configured to provide a preferred footprint length of duplex for use with a particular nucleic acid modifying enzyme. In some embodiments, such assays are used for target quantification, and in other embodiments, such assays are used for genotyping. In certain embodiments, the use of such short probes allows for assays with increased dynamic range.

La présente invention concerne des systèmes, des procédés et des kits pour effectuer une analyse de détection (par exemple une analyse de clivage invasif) en combinaison avec une analyse damplification (par exemple PCR), lanalyse de détection employant des sondes dempreinte denzyme avec des régions précises de substance à analyser relativement courtes (par exemple de 6 à 12 bases) configurées pour fournir une longueur dempreinte préférée de duplex à utiliser avec une enzyme de modification dacide nucléique particulière. Dans certains modes de réalisation, de telles analyses sont utilisées pour cibler une quantification, et dans dautres modes de réalisation, de telles analyses sont utilisées pour le génotypage. Dans certains modes de réalisation, lutilisation de telles sondes courtes permet des analyses ayant une portée dynamique accrue.

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