Compositions and methods for enhanced sensitivity and...

A - Human Necessities – 01 – N

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A01N 37/18 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2421391

The present invention relates to cationic and polycationic compositions and methods for enhancing synthesis of nucleic acid molecules. In a preferred aspect, the invention relates to inhibition or control of nucleic acid synthesis, sequencing or amplification. Specifically, the present invention discloses cationic and polycationic molecules, compounds, and compositions having affinity for double-stranded and/or single-stranded nucleic acid molecules and/or single-stranded/double-stranded nucleic acid complexes (e.g., primer/template complexes, double-stranded templates, single-stranded templates or single-stranded primers) for use in such enhanced synthesis. The cationic and polycationic molecules, compounds, and compositions of the invention are capable of inhibiting nonspecific nucleic acid synthesis at ambient temperature. Thus, in a preferred aspect, the invention relates to "hot start" synthesis of nucleic acid molecules. Accordingly, the invention prevent non-specific nucleic acid synthesis at low temperatures, for example during reaction set up. The invention also relates to kits for synthesizing, amplifying, reverse transcribing or sequencing nucleic acid molecules comprising one or more of the cationic and polycationic molecules, compounds, and compositions of the invention. The invention also relates to compositions prepared for carrying out the methods of the invention and to compositions made after or during such methods. The invention also generally relates to compositions useful for inhibiting or preventing degradation of various nucleic acid molecules.

L'invention concerne des compositions cationiques et polycationiques, ainsi que des procédés pour améliorer la synthèse de molécules d'acide nucléique. Dans un mode de réalisation préféré, l'invention concerne l'inhibition ou la régulation de la synthèse, du séquençage ou de l'amplification d'acide nucléique. D'une manière spécifique, la présente invention porte sur des molécules, des composés et des compositions cationiques et polycationiques, présentant une affinité pour les molécules d'acide nucléique à double brin et/ou à simple brin et/ou les complexes d'acide nucléique à double brin/à simple brin (à savoir, les complexes amorce/matrice, les matrices à double brin, les matrices à simple brin ou les amorces à simple brin), pour l'utilisation dans une synthèse améliorée de ce type. Selon l'invention, les molécules, les composés et les compositions cationiques et polycationiques sont aptes à inhiber la synthèse d'acide nucléique non spécifique à température ambiante. Dans un mode de réalisation préféré, l'invention concerne la synthèse dite de "hot start" de molécules d'acide nucléique. Ainsi, l'invention permet d'empêcher la synthèse d'acide nucléique non spécifique à faibles températures, par exemple, lors de la mise au point de la réaction. L'invention concerne également des trousses de synthèse, d'amplification, de transcription inverse ou de séquençage de molécules d'acide nucléique comprenant un(e) ou plusieurs molécules, composés et compositions cationiques et polycationiques susmentionnés. L'invention porte en outre sur des compositions préparées pour réaliser lesdits procédés, et sur des compositions créées après ou pendant ces procédés. Enfin, la présente invention concerne en règle générale des compositions pour inhiber ou prévenir la dégradation de plusieurs molécules d'acide nucléique.

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