Compositions and methods for modeling saccharomyces...

C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B

Patent

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C40B 30/02 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 50/02 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01) C12N 1/16 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2462099

The invention provides an in silica model for determining a S. cerevisiae physiological function. The model includes a data structure relating a plurality of S. cerevisiae reactants to a plurality of S. cerevisiae reactions, a constraint set for the plurality of S. cerevisiae reactions, and commands for determining a distribution of flux through the reactions that is predictive ofa s. cerevisiae physiological function. A model of the invention can further include a gene database containing information characterizing the associated gene or genes. The invention further provides methods for making an in silica S. cerevisiae model and methods for determining a S. cerevisiae physiological function using a model of the invention.

La présente invention concerne un modèle à base de silice destiné à déterminer une fonction physiologique de S. cerevisiae. Ce modèle comprend une structure de données reliant une pluralité de réactifs de S. cerevisiae à une pluralité de réactions de S. cerevisiae, un ensemble de contraintes destinées à la pluralité des réactions de S. cerevisiae et des commandes destinées à déterminer une distribution de flux à travers les réactions qui est prédictive d'une fonction physiologique deS. cerevisiae. Un modèle de cette invention peut aussi comprendre une base de données de gènes contenant des informations qui caractérisent le ou les gènes associés. Cette invention concerne aussi des procédés de fabrication d'un modèle de S. cerevisiae à base de silice et des procédés de détermination d'une fonction physiologique de S. cerevisiae au moyen du modèle de cette invention.

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