Compositions and methods for the identification of a...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01)

Patent

CA 2682299

Compositions and methods for the rapid and sensitive detection of a carbapenemase in a sample is provided. The compositions include novel primer and probe compositions for use in detecting the presence of this enzyme in a sample, particularly using PCR methods. These primers and probe sets can be used in amplification methods (such as PCR, particularly quantitative PCR) and packaged into kits for use in amplification methods for the purpose of detecting carbapenemase in a test sample, particularly a patient sample, particularly a direct sample. Thus, in one embodiment, the present invention provides for novel oligonucleotide primers set forth in SEQ ID NOs: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 14, 15, 17, 18, and 20, and the novel oligonucleotide probe sequences set forth in SEQ ID NOs:3, 6, 9, 16, and 19. These sequences can be used in a method of detecting carbapenemase in a sample.

L'invention propose des compositions et des procédés pour la détection rapide et sensible d'une carbapénèmase dans un échantillon. Les compositions comprennent de nouvelles compositions d'amorces et de sondes pour une utilisation dans la détection de la présence de cette enzyme dans un échantillon, en particulier à l'aide des méthodes de PCR. Ces ensembles d'amorces et de sonde peuvent être utilisés dans des méthodes d'amplification (telles qu'une PCR, en particulier une PCR quantitative) et conditionnés dans des coffrets pour une utilisation dans des méthodes d'amplification dans le but de détecter une carbapénèmase dans un échantillon de test, notamment un échantillon de patient, en particulier un échantillon direct. Ainsi, dans un mode de réalisation, la présente invention propose de nouvelles amorces oligonucléotidiques établies dans les SEQ ID N°: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 14, 15, 17, 18 et 20, et sur les nouvelles séquences de sonde oligonucléotidique établies dans SEQ ID N°:3, 6, 9, 16 et 19. Ces séquences peuvent être utilisées dans un procédé de détection de la carbapénèmase dans un échantillon.

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