Conformational and topological protein regulation

Details Conformational and topological protein regulation Conformational and topological protein regulation

G - Physics

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N

G01N 33/68 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) C07K 16/18 (2006.01) C12N 5/00 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) A61K 39/00 (2006.01)

Patent

CA 2394609

Methods and compositions are provided for identifying novel conformers of proteins not known to exist as different conformers. By using chimeric genes replacing a native signal sequence with a different signal sequence resulting in the production of a conformer, one can compare the native protein with the product of the chimeric gene. Where the conformations are different, the different protein may be used for production of antibodies, elucidation of mechanisms associated with the native and different conformer protein, assays for the presence of the different conformer in physiological samples, identification of compounds specifically binding to the conformer, particularly drugs, etc. Where the formation of the conformer is associated with a diseased state, the conformer may be used in screens to identify compounds as drug candidates.

L'invention concerne des méthodes et des compositions s'utilisant dans l'identifications de nouveaux conformères de protéines inconnus en tant que conformères différents. En utilisant des gènes chimères remplaçant une séquence du signal d'origine avec une séquence de signal différente, donnant lieu à la production d'un conformère, on peut comparer la protéine d'origine avec le produit du gène chimère. Lorsque les conformations sont différentes, la protéine différente peut s'utiliser dans la production d'anticorps, l'élucidation de mécanismes associés à la protéine conformère d'origine et différente, des analyses de la présence du conformère différent dans des échantillons physiologiques, et l'identification de composés se liant de manière spécifique au conformère, notamment des médicaments, etc. Lorsque la formation du conformère est associée à un état pathologique, ce conformère peut être utilisé dans des criblages visant à identifier des composés en tant que médicaments candidats.

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