Data-dependent accurate mass neutral loss analysis

Details Data-dependent accurate mass neutral loss analysis Data-dependent accurate mass neutral loss analysis

G - Physics

01

N

G01N 27/00 (2006.01) G01N 33/483 (2006.01) H01J 49/26 (2006.01)

Patent

CA 2667384

A method is disclosed for data-dependent neutral loss analysis of biomolecules and other materials in a hybrid mass spectrometer. Candidate product ions are selected by identifying peaks in a MS/MS spectrum acquired in a first mass analyzer that exhibit a specified nominal neutral loss value, which may be representative of the mass of a peptide modification, such as phosphate. High mass accuracy MS and MS/MS spectra acquired at a second mass analyzer, such as an FTICR or Orbitrap, are processed to determine if the mass difference between a candidate product ion and its corresponding precursor matches an accurate neutral loss value. In one embodiment, MS3 analysis is performed only on the candidate product ions that satisfy the accurate mass neutral loss value test.

Procédé d'analyse de perte neutre dépendante des données de biomolécules et d'autres matériaux dans un spectromètre de masse hybride. Les ions du produit candidat sont choisis en identifiant des pics dans un spectre MS/MS acquis dans un premier analyseur de masse qui présentent une valeur de perte neutre nominale spécifiée, qui peut être représentative de la masse d'une modification d'un peptide tel qu'un phosphate. Des spectres MS et MS/MS de précision de masse élevée acquis avec un second analyseur de masse tel qu'un FTICR ou Orbitrap, sont traités pour déterminer si la différence de masse entre un ion de produit candidat et son précurseur correspondant correspond à une valeur de perte neutre précise. Dans un mode de réalisation, l'analyse de MS3 est réalisée uniquement sur les ions du produit candidat qui satisfont au test de la valeur de perte neutre de masse précise.

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