Design of high affinity rnase h recruiting oligonucleotide

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 15/11 (2006.01) A61K 48/00 (2006.01) C07H 19/06 (2006.01) C07H 19/16 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)

Patent

CA 2385853

The present invention relates to the field of bicyclic DNA analogues, e.g. LNA and LNA modifications, which are useful for designing oligomers that form high affinity duplexes with complementary RNA wherein said duplexes are substrates for RNase H. The oligonucleotides may be partially or fully composed of LNA analogues with very high affinity and ability to recruit RNase H. The implications are that oxy-LNA by itself may be used to construct novel antisense molecules with enhanced biological activity. Alternatively, oxy-LNA may be used in combination with non-oxy-LNA, such as standard DNA, RNA or other analogues, e.g. thio-LNA or amino-LNA, to create high affinity, RNase H recruiting anti-sense compounds without the need to adhere to any fixed design.

La présente invention a trait au domaine des analogues d'ADN bicycliques, par exemple les ALN et les modifications d'ALN, qui sont utilisés pour mettre au point des oligomères formant des duplex à haute affinité avec les ARN complémentaires, les duplex étant des substrats de Rnase H. Les oligonucléotides de l'invention peuvent être partiellement ou entièrement composés d'analogues d'ALN possédant une très haute affinité et une très haute capacité de recrutement de la RNase H. Grâce à la présente invention, on peut utiliser l'oxy-ALN seul pour construire de nouvelles molécules antisens présentant une activité biologique améliorée. Dans un autre mode de réalisation, on peut utiliser l'oxy-ALN en combinaison avec des ALN non oxy, tels que l'ADN, l'ARN ordinaires ou analogues, par exemple, le thio-ALN ou l'amino-ALN, pour créer des composés antisens de recrutement de RNase H à haute affinité sans qu'il soit nécessaire de s'en tenir à une structure rigide.

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