Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes,...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/00 (2006.01) C12N 9/96 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2176266

Unimolecular and bimolecular hybridization probes for the detection of nucleic acid target sequences comprise a target complement sequence, an affinity pair holding the probe in a closed conformation in the absence of target sequence, and either a label pair that interacts when the probe is in the closed conformation or, for certain unimolecular probes, a non-interactive label. Hybridization of the target and target complement sequences shifts the probe to an open conformation. The shift is detectable due to reduced interaction of the label pair or by detecting a signal from a non-interactive label. Certain unimolecular probes can discriminate between target and non-target sequences differing by as little as one nucleotide. Also, universal stems and kits useful for constructing said probes. Also, assays utilizing said probes and kits for performing such assays.

Les sondes d'hybridation unimoléculaires et bimoléculaires destinées à la détection de séquences cibles d'acides nucléiques comprennent une séquence cible complémentaire, une paire d'affinité maintenant la sonde dans une conformation fermée en l'absence de la séquence cible, et une paire marquée interagissant lorsque la sonde se trouve dans une conformation fermée ou, dans le cas de certaines sondes unimoléculaires, un marqueur non interactif. L'hybridation de la séquence cible et de la séquence cible complémentaire induit un changement de conformation de la sonde, laquelle s'ouvre. Ce changement est décelable en raison de l'interaction réduite de la paire marquée ou du signal émis par le marqueur non interactif. Certaines sondes unimoléculaires permettent de distinguer les séquences cibles et les séquences non ciblées même si elles ne diffèrent que d'un nucléotide. L'invention porte aussi sur des structures universelles et des trousses utiles pour fabriquer lesdites sondes. Elle concerne également des essais utilisant lesdites sondes et des trousses permettant de réaliser ces essais.

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