Detection of corrosion-inducing prokaryotes

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2673577

A simple method for the collection of field samples for nucleic acid extraction and subsequential detection of microorganisms from various media such as aqueous samples, sediments and biofilms (sessile bacteria). This method is a quantitative polymerase chain reaction (PCR)-based technique for detection of SRP in various media (i.e., aqueous samples, sediments, biofilms). The principle of this technique is based on the fact that all prokaryotes (Bacteria and Archaea) able to carry out sulfate reduction possess a gene that encodes dissimilatory sulfite reductase (DSR), the key enzyme in the sulfate reduction pathway. Microbial induced corrosion is due to bacterial growth and thus, tests for the detection of bacterial growth in fluids involved in oil processing are routinely performed. Thus far, the widely accepted methods for detection of bacterial growth of microorganisms involved in corrosion are cultivation dependent and, therefore, these methods underestimate the number of microorganisms present in a sample and require long incubation times.

L'invention concerne un procédé simple pour prélever des échantillons de champ pour une extraction d'acide nucléique et une détection subséquente de micro-organismes provenant de divers milieux tels des échantillons aqueux, des sédiments et des biofilms (bactéries sessiles). Ce procédé est une technique à base de réaction en chaîne de polymérase quantitative (PCR) pour la détection de SRP dans divers milieux (c'est-à-dire des échantillons aqueux, des sédiments, des biofilms). Le principe de cette technique est fondé sur le fait que tous les procaryotes (bactérie et archéobactérie) capables d'effectuer une réduction de sulfate possèdent un gène qui encode la sulfite réductase dissimulatrice (DSR), l'enzyme clé dans le trajet de réduction de sulfate. Une corrosion induite de manière microbienne est due à une croissance bactérienne, et ainsi des tests pour la détection d'une croissance bactérienne dans des fluides impliqués dans le traitement du pétrole sont effectués de manière routinière. Jusqu'à présent, les procédés largement acceptés pour la détection d'une croissance bactérienne de micro-organismes impliquée dans la corrosion dépendent d'une culture et, par conséquent, ces procédés sous-estiment le nombre de micro-organismes présents dans un échantillon, et nécessitent de longues périodes d'incubation.

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