Detection of dna mismatches and oxidative lesions

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2569597

The present invention describes methods for directly labeling the 3~-phosphate end at a nucleotide mismatch site. Further, as internal 3~-phosphate termini on DNA duplexes are also associated generally with oxidative lesions, these methods provide a general strategy for labeling, and therefore, detecting the frequency of oxidative DNA lesions. The present invention also discloses labeling methods using terminal transferase or nontemplated DNA polymerization, where the use of either of these activities affords tagging a site, after removal of the 3~-phosphate, with polynucleotide tails. Such polynucleotide tails in turn can function as primer binding sites for use in PCR in gene analyses.

La présente invention concerne des méthodes de marquage direct de l'extrémité 3'-phosphate présente au niveau d'un site de mésappariement de nucléotide. De plus, étant donné que les terminaisons 3'-phosphate internes sur les duplexes d'ADN sont également associées en général à des lésions oxydantes, ces méthodes constituent une stratégie globale de marquage et par conséquent, de détection de la fréquence des lésions d'ADN oxydantes. La présente invention se rapporte également à des méthodes de marquage au moyen d'une transférase terminale ou par polymérisation d'ADN non matricé, pour lesquelles l'utilisation de l'une ou l'autre de ces activités permet de marquer un site, après l'élimination du 3'-phosphate, avec des queues polynucléotidiques. Ces queues polynucléotidiques peuvent à leur tour, faire office de sites de liaison d'amorce destinés à être utilisés dans la RCP dans des analyses génétiques.

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