C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2366249
The present invention describes a method for identifying one or more of a plurality of sequences differing by one or more single base changes, insertions, deletions, or translocations in a plurality of target nucleotide sequences. The ligation phase utilizes a ligation detection reaction between one oligonucleotide probe which has a target sequence-specific portion and an addressable array-specific portion, and a second oligonucleotide probe, having a target sequence specific portion and a detectable label. After the ligation phase, the capture phase is carried out by hybridizing the ligated oligonucleotide probes to a solid support with an array of immobilized capture oligonucleotides at least some of which are complementary to the addressable array-specific portion. Following completion of the capture phase, a detection phase is carried out to detect the labels of ligated oligonucleotide probes hybridized to the solid support. The ligation phase can be preceded by an amplification process. The present invention also relates to a kit for practicing this method, a method of forming arrays on solid supports, and the supports themselves.
L'invention concerne un procédé permettant d'identifier au moins une séquence qui diffère par au moins un changement, insertion, effacement ou translocation de base dans plusieurs séquences nucléotidiques cibles. Dans la phase de ligature, on fait appel à une réaction de détection de ligature entre une sonde d'oligonucléotide, qui a une partie spécifique à la séquence cible et une partie spécifique à un réseau adressable, et une seconde sonde d'oligonucléotide ayant une partie spécifique à la séquence cible et un marqueur détectable. Après la phase de ligature, on procède à la phase de capture par hybridation à un support solide des sondes d'oligonucléotide ligaturées à l'aide d'un réseau d'oligonucléotides de capture immobilisés, dont au moins un certain nombre est complémentaire à la partie spécifique au réseau adressable. Une fois la phase de capture achevée, une phase de détection est entamée afin de détecter des marqueurs de sondes d'oligonucléotide ligaturées, hybridées au support solide. On peut faire précéder la phase de ligature par un processus d'amplification. L'invention porte également sur une trousse conçue pour mettre en oeuvre ce procédé, un procédé de formation de réseaux sur des supports solides, et sur les supports eux-mêmes.
Barany Francis
Barany George
Day Joseph
Gerry Norman P.
Hammer Robert P.
Board Of Supervisors Of Louisiana State University And Agricultu
Cornell Research Foundation Inc.
Gowling Lafleur Henderson Llp
Regents Of The University Of Minnesota
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1512773