C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12Q 1/25 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01) C40B 60/08 (2006.01)
Patent
CA 2244891
The present invention describes a method for identifying one or more of a plurality of sequences differing by one or more single base changes, insertions, deletions, or translocations in a plurality of target nucleotide sequences. The method includes a ligation phase, a capture phase, and a detection phase. The ligation phase utilizes a ligation detection reaction between one oligonucleotide probe, which has a target sequence-specific portion and an addressable array-specific portion, and a second oligonucleotide probe, having a target sequence-specific portion and a detectable label. After the ligation phase, the capture phase is carried out by hybridizing the ligated oligonucleotide probes to a solid support with an array of immobilized capture oligonucleotides at least some of which are complementary to the addressable array--specific portion. Following completion of the capture phase, a detection phase is carried out to detect the labels of ligated oligonucleotide probes hybridized to the solid support. The ligation phase can be preceded by an amplification process. The present invention also relates to a kit for practicing this method, a method of forming arrays on solid supports, and the supports themselves.
La présente invention concerne un procédé permettant d'identifier une ou plusieurs séquences qui diffèrent par un ou plusieurs changements, insertions, effacements ou translocations de base, dans plusieurs séquences nucléotidiques cibles. Ce procédé comprend une phase de ligature, une phase de capture et une phase de détection. La phase de ligature fait appel à la réaction de détection de ligature entre une première sonde d'oligonucléotide, laquelle possède une partie spécifique à la séquence cible ainsi qu'une partie spécifique à un réseau adressable, et une seconde sonde d'oligonucléotide qui possède une partie spécifique à la séquence cible ainsi qu'un marqueur détectable. Après la phase de ligature, on procède à la phase de capture en hybridant à un support solide les sondes d'oligonucléotide ligaturées, ceci à l'aide d'un réseau d'oligonucléotides de capture immobilisés dont quelques-uns au moins sont complémentaires à la partie spécifique au réseau adressable. Une fois la phase de capture terminée, on lance la phase de détection afin de détecter les marqueurs des sondes d'oligonucléotide ligaturées qui ont été hybridées au support solide. La phase de ligature peut être précédée d'un processus d'amplification. Cette invention concerne également un nécessaire permettant de mettre en oeuvre ce procédé, un procédé de formation de réseaux sur des supports solides, ainsi que les supports solides eux-mêmes.
Barany Francis
Barany George
Blok Herman
Hammer Robert P.
Kempe Maria
Cornell Research Foundation Inc.
Gowling Lafleur Henderson Llp
Louisiana State University
Regents Of The University Of Minnesota
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1827387