Detection of spore forming bacteria

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2443441

Disclosed are methods, probes, and nucleic acid sequences for the systematic identification of sporulation genes in spore forming bacteria. A probe comprises a nucleic acid sequence able to form a detectable hybrid with highly conserved regions of the spoOA gene of certain spore forming bacteria Bacillus and Clostridium bacteria species, said nucleic acid sequence being unable to form a detectable hybrid with genetic material of non-spore forming bacteria. Amplification of a portion of the spoOA gene from the cellular DNA of a spore forming bacteia by a polymerase chain reaction using such probe, primer or nucleic acid sequence as one member of a primer set results in the generation of a detectable 346-365 nucleotide long DNA product. One disclosed method comprises a) combining a tagged or labeled probe with a sample, b) hybridizing the probe to the target spore forming bacteria spoOA gene; and c) detecting the hybridized product.

L'invention concerne des procédés, des sondes, des amorces et des séquences d'acide nucléique pour l'identification systématique de gènes de sporulation dans des bactéries formant des spores. Une sonde comprend une séquence d'acide nucléique pouvant former un hybride détectable à régions hautement préservées du gène <i>spo0A</i> de certaines espèces de bactéries <i>Bacillus</i> et <i>Clostridium</i> de bactéries formant des spores, ladite séquence d'acide nucléique ne pouvant pas former un hybride détectable avec du matériel génétique de bactéries ne formant pas de spores. L'invention concerne l'amplification d'une partie de gène <i>spoOA </i> provenant de l'ADN cellulaire d'une bactérie formant des spores par le biais d'une réaction en chaîne de polymérase faisant appel à une telle sonde, une amorce ou une séquence d'acide nucléique, en tant qu'élément de résultats d'un ensemble d'amorces de la génération d'un produit d'ADN long de 346 à 365 nucléotides détectables. Un procédé consiste à: (a) combiner une sonde marquée à un échantillon, (b) effectuer l'hybridation de la sonde sur le gène <i>spoOA</i> de la bactérie formant des spores; et (c) détecter le produit ayant subi une hybridation.

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