Determination and prediction of the expression of traits of...

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 30/72 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)

Patent

CA 2673603

The present invention relates to a method for determining the correlation between the metabolite profiles (MPs) and the expression or potential for expression of a trait of a group of plants, and further to a method for determining or predicting the expression of a trait of a plant by taking advantage of the determined MP of said plant and a determined correlation between the MPs and the expression or potential for the expression of said trait in a group of plants. Particularly, the present invention relates to a method for determining or predicting the biomass production/growth rate of a plant by taking advantage of the determined MP of said plant and a determined correlation between the MPs and the biomass production/growth rate or the potential for biomass production/growth rate of a group of plants. The present invention also relates to a method for breeding of a plant that takes advantage of a method of determining the expression or potential for expression of a trait of said plant according to any one of the methods as disclosed, and selecting said plant on the basis of the expression or potential for expression of said trait. Furthermore, the present invention relates to a method for identifying quantitative trait loci (QTLs) for a trait or for the potential for expression of a trait of a group of plants comprising the step of identifying QTLs for metabolite combinations showing correlation with the expression or potential for expression of said trait of said group of plants. The present invention also relates to and a method for identifying a candidate gene involved in the determination of expression or potential for expression of a trait of a plant comprising the step of isolating a gene corresponding to any one of the QTLs as identified by the corresponding method of the present invention. Additionally, the present invention relates to a method of screening for a plant that exhibits a desired expression or potential for expression of a trait as well as to a method of determining whether a treatment influences the expression or potential for expression of a trait of a plant.

La présente invention concerne un procédé permettant de déterminer la corrélation entre les profils de métabolites (MP) et l'expression ou le potentiel d'expression d'un caractère d'un groupe de plantes, et en outre un procédé permettant de déterminer ou de prédire l'expression d'un caractère d'une plante en profitant du MP de ladite plante déterminé et d'une corrélation déterminée entre les MP et l'expression ou le potentiel d'expression dudit caractère dans un groupe de plantes. En particulier, la présente invention concerne un procédé permettant de déterminer ou de prévoir la production de biomasse/vitesse de croissance d'une plante en profitant du MP de ladite plante déterminé et d'une corrélation déterminée entre les MP et la production de biomasse/vitesse de croissance ou le potentiel de production de biomasse/vitesse de croissance d'un groupe de plantes. La présente invention concerne également un procédé permettant la reproduction d'une plante qui profite d'un procédé permettant de déterminer l'expression ou le potentiel d'expression d'un caractère de ladite plante selon l'un quelconque des procédés tels que décrits, et la sélection de ladite plante sur la base de l'expression ou du potentiel d'expression dudit caractère. De plus, la présente invention concerne un procédé permettant d'identifier des locus quantitatifs (QTL) d'un caractère ou du potentiel d'expression d'un caractère d'un groupe de plantes qui comprend l'étape consistant à identifier les QTL pour détecter les combinaisons de métabolites présentant une corrélation avec l'expression ou le potentiel d'expression dudit caractère dudit groupe de plantes. La présente invention concerne aussi un procédé permettant d'identifier un gène candidat impliqué dans la détermination de l'expression ou du potentiel d'expression d'un caractère d'une plante qui comprend l'étape consistant à isoler un gène correspondant à l'un quelconque des QTL tels qu'identifiés dans le procédé correspondant de la présente invention. En outre, l'invention concerne un procédé de criblage d'une plante qui présente une expression souhaitée ou un potentiel souhaité d'expression d'un caractère aussi bien qu'un procédé permettant de déterminer si un traitement influence l'expression ou le potentiel d'expression d'un caractère d'une plante.

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