C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2673784
In particular aspects, stem-cell polycomb group (PcG) targets are more likely to have cancer-specific promoter DNA methylation than non-targets, indicating a stem-cell origin of cancer, where reversible gene repression is replaced by permanent silencing, locking the cell into a perpetual state of self-renewal and predisposition to subsequent malignant transformation. Exemplary aspects provide methods for identifying preferred DNA methylation markers for a cellular proliferative disorder and/or cancer and markers for developmental lineages and/or stages, based on identifying PcG protein or PcG repressive complex genomic target loci within a precursor cell (e.g., stem or progenitor cell) population, and determining, in cells of the proliferative disorder and/or cancer or cell of the particular developmental lineages and/or stages, a characteristic methylation status of the PcG target loci. Additional aspects provide methods for validating and/or monitoring a precursor cell (e.g., stem cell) population. Diagnostic and prognostic methods for ovarian and breast cancer are provided.
L'invention concerne, dans des aspects particuliers, des cibles de groupes polycomb de cellule souche (PcG) qui sont plus susceptibles d'avoir une méthylation d'ADN de promoteur spécifique au cancer que les non-cibles, indiquant une origine de cellule souche de cancer, où une répression génique réversible est remplacée par un silençage permanent, enfermant la cellule dans un état perpétuel d'auto-renouvellement et de prédisposition à une transformation maligne ultérieure. Des aspects donnés à titre d'exemple fournissent des procédés pour l'identification de marqueurs de méthylation d'ADN préférés pour un trouble de prolifération cellulaire et/ou un cancer et des marqueurs pour des lignées évolutives et/ou des stades évolutifs, basés sur l'identification de la protéine de PcG ou d'emplacements cibles génomiques complexes répressifs dans une population de cellules précurseurs (par exemple, cellules souches ou progénitrices), et la détermination, dans des cellules du trouble de prolifération et/ou du cancer ou une cellule des lignées évolutives et/ou stades évolutifs particuliers, d'un statut de méthylation caractéristique des emplacements cibles de PcG. Des aspects supplémentaires fournissent des procédés pour la validation et/ou la surveillance d'une population de cellules précurseurs (par exemple, cellules souches). Les procédés de diagnostic et de pronostic pour un cancer ovarien et un cancer du sein sont fournis.
Laird Peter W.
Widschwendter Martin
Smart & Biggar
University College London
Usc Stevens-University Of Southern California
LandOfFree
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