C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/54 (2006.01) A61K 31/70 (2006.01) C07K 7/08 (2006.01) C07K 14/03 (2006.01) C07K 16/40 (2006.01) C12N 9/12 (2006.01) C12N 9/96 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/48 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/569 (2006.01) A61K 39/00 (2006.01)
Patent
CA 2226872
This invention provides isolated polynucleotides encoding DNA polymerases of three members of a subfamily of gamma herpes viruses. Two were obtained from macaque monkeys affected with retroperitoneal fibromatosis, the other from human AIDS patients affected with Kaposi's sarcoma. A 454-base pair fragment encoding a region near the active site of the DNA polymerase is 69-83 % identical amongst the three viruses, but only 54-68 % identical with other known gamma herpes sequences and < 55 % identical with alpha and beta herpes sequences. Also provided are ploynucleotides encoding DNA polymerase from related viruses in the RFHV/KSHV subfamily. Polynucleotides prepared according to the sequence data can be used as reagents to detect and characterize related sequences. Such reagents may be used to detect members of the RFHV/KSHV subfamily, including but not limited to RFHV, RFHV2, and KSHV. Corresponding polypeptides and peptide fragments may be obtained by expressing the polynucleotide or by chemical synthesis. They may be used for detecting specific antibody potentially present in the serum of infected subjects. They may also be used for designing or screening pharmaceutical compounds that limit viral replication by inhibiting DNA polymerase activity.
La présente invention concerne des polynucléotides isolés codant des ADN-polymérases, pour trois membres d'une sous-famille de virus d'herpès gamma. Deux d'entre eux ont été obtenus sur des macaques atteints de fibromatose rétropéritonéale, le troisième sur des patients humains atteints du SIDA et souffrant de la maladie de Kaposi. Un fragment à 454 paires de bases codant une région proche du site actif de l'ADN-polymérase présente une homologie de 69 à 83 % par rapport aux trois virus, mais seulement de 54 à 68 % par rapport à d'autres séquences connues d'herpès gamma, et de moins de 55 % par rapport aux séquences d'herpès alpha et bêta. L'invention concerne aussi des polynucléotides codant l'ADN-polymérase provenant de virus apparentés, dans la sous-famille RFHV/KSHV. Les polynucléotides préparés selon les données des séquences peuvent être utilisés comme réactifs pour détecter et caractériser des séquences apparentées. Des réactifs de ce genre peuvent être utilisés pour détecter des membres de la sous-famille RFHV/KSHV, notamment, mais non exclusivement: RFHV, RFHV2 et KSHV. Les polypeptides et fragments de peptides correspondants peuvent être obtenus par expression du polynucléotide ou par synthèse chimique. Ils peuvent être utilisés pour détecter des anticorps spécifiques potentiellement présents dans le sérum de sujets contaminés. Ils peuvent aussi être utilisés pour concevoir ou cribler des composés pharmaceutiques qui limitent la réplication virale en inhibant l'activité de l'ADN-polymérase.
Bosch Marnix L.
Rose Timothy M.
Strand Kurt
Todaro George J.
Mbm & Co.
University Of Washington
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1618682