Dual resonance energy transfer nucleic acid probes

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) G01N 21/64 (2006.01) G01N 21/78 (2006.01)

Patent

CA 2451614

Dual nucleic acid probes with resonance energy transfer moieties are provided. In particular, fluorescent or luminescent resonance energy transfer moieties are provided on hairpin stem-loop molecular beacon probes that hybridize sufficiently near each other on a subject nucleic acid, e.g. mRNA, to generate an observable interaction. The invention also provides lanthanide chelate luminescent resonance energy transfer moieties on linear and stem-loop probes that hybridize sufficiently near each other on a subject nucleic acid to generate an observable interaction. The invention thereby provides detectable signals for rapid, specific and sensitive hybridization determination in vivo. The probes are used in methods of detection of nucleic acid target hybridization for the identification and quantification of tissue and cell- specific gene expression levels, including response to external stimuli, such as drug candidates, and genetic variations associated with disease, such as cancer.

L'invention concerne des sondes d'acide nucléique à fractions de transfert d'énergie de résonance. L'invention concerne en particulier des fractions de transfert d'énergie de résonance fluorescentes ou luminescentes sur des sondes de balise moléculaire en épingle à cheveux (tige- boucle) qui s'hybrident tout en étant proches les unes des autres sur un acide nucléique chez un sujet, par exemple ARNm, pour générer une interaction observable. L'invention concerne également des fractions de transfert d'énergie par résonance luminescente chélatées et lanthanidiques sur des sondes de boucles linéaires et en épingle à cheveux, lesdits échantillons s'hybridant tout en restant les uns à côté des autres sur un acide nucléique d'un sujet, pour générer une interaction observable. Grâce à l'invention on obtient de cette façon des signaux détectables pour une détection d'hybridation rapide, spécifique et efficace in vivo. Les sondes sont utilisées dans des méthodes de détection d'hybridation d'acide nucléique cible utilisées dans l'identification et la quantification de tissus et de niveaux d'expression de gènes de cellules spécifiques, comprenant une réponse à des stimuli externes tels que des candidats-médicaments, et des variations génétiques associées aux maladies telles que le cancer.

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