C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) A61K 31/198 (2006.01) A61K 31/245 (2006.01) A61K 31/706 (2006.01) A61K 31/7068 (2006.01) A61K 45/00 (2006.01) A61P 35/00 (2006.01) C12Q 1/04 (2006.01) C40B 30/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)
Patent
CA 2656807
A genome wide microarray gene expression approach for human colorectal cancer cells was used to identify hundreds of hypermethylated genes for colon cancer. We compared isogenic cells altered pharmacologically versus genetically to induce genomic demethylation, to pinpoint genes activated by DNA demethylation, but not by inhibition of class I and II histone deacetylases (HDACs). We achieve an 82% success rate in predicting genes with densely hypermethylated CpG islands and complete gene silencing. The genes are similarly hypermethylated in primary tumors and have previously undetected tumor suppressor functions. The genes can be used diagnostically to detect cancer, pre-cancer, and likelihood of developing cancer.
La présente invention applique l'approche de l'expression génique sur micropuces à ADN à l'échelle du génome entier aux cellules du cancer colorectal humain afin d'identifier des centaines de gènes hyperméthylés dans le cancer du côlon. Selon l'invention, on compare des cellules isogéniques pharmacologiquement modifiées à des cellules isogéniques génétiquement modifiées pour induire une déméthylation génomique afin de mettre en évidence les gènes activés par la déméthylation de l'ADN, mais pas par l'inhibition des histone-désacétylases (HDAC) de classe I et II. Le taux de succès rencontré a été de 82% dans la prédiction des gènes présentant des îlots CpG densément hyperméthylés et un silençage de gène entier. Les gènes sont hyperméthylés de manière similaire dans les tumeurs primaires et possèdent des fonctions de suppression tumorale qui n'avaient pas encore été détectées jusqu'alors. Les gènes peuvent servir à une utilisation diagnostique visant à détecter les cancers, les précancers et les risques de développer un cancer.
Baylin Stephen B.
Cope Leslie
Criekinge Wim Van
Herman Jim
Schuebel Kornel E.
Gowling Lafleur Henderson Llp
Mdxhealth
Oncomethylome Sciences S.a.
The Johns Hopkins University
LandOfFree
Early detection and prognosis of colon cancers does not yet have a rating. At this time, there are no reviews or comments for this patent.
If you have personal experience with Early detection and prognosis of colon cancers, we encourage you to share that experience with our LandOfFree.com community. Your opinion is very important and Early detection and prognosis of colon cancers will most certainly appreciate the feedback.
Profile ID: LFCA-PAI-O-1938977