Epigenetic change in selected genes and cancer

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2674988

A method of detecting a predisposition to, or the incidence of, cancer in a sample comprises detecting an epigenetic change in at least one gene selected from an NDRG4/NDRG2 subfamily gene, GATA4, OSMR, GATA5, SFRPl, ADAM23, JPH3, SFRP2, APC, MGMT, TFPI2, BNIP3, FOXEl, SYNEl, S0X17, PHACTR3 and JAM3, wherein detection of the epigenetic change is indicative of a predisposition to, or the incidence of, cancer. Also described are pharmacogenetic methods for determining suitable treatment regimens for cancer and methods for treating cancer patients, based around selection of the patients according to the methods of the invention. The present invention is also concerned with improved methods of collecting, processing and analyzing samples, in particular body fluid samples. These methods may be useful in diagnosing, staging or otherwise characterizing various diseases. The invention also relates to methods for identifying, diagnosing, staging or otherwise characterizing cancers, in particular gastrointestinal cancers such as colorectal cancers, gastric cancers and oesophageal cancers. The methods of the invention relate, inter alia, to isolating and analyzing the human DNA component from faecal samples and blood-based samples.

L'invention porte sur un procédé de détection d'une prédisposition à ou de l'occurrence d'un cancer dans un échantillon. Ce procédé comprend la détection d'un changement épigénétique dans au moins un gène choisi parmi un gène de la sous-famille NDRG4/NDRG2, GATA4, OSMR, GATA5, SFRPl, ADAM23, JPH3, SFRP2, APC, MGMT, TFPI2, BNIP3, FOXEl, SYNEl, S0X17, PHACTR3 et JAM3, la détection du changement épigénétique étant indicative d'une prédisposition à ou de l'occurrence d'un cancer. L'invention porte également sur des procédés pharmacogénétiques pour déterminer des régimes de traitement appropriés pour un cancer et sur des procédés pour traiter des patients atteints de cancer, sur la base d'une sélection des patients selon les procédés de détection selon l'invention. La présente invention porte aussi sur des procédés perfectionnés de collecte, de traitement et d'analyse d'échantillons en particulier d'échantillons de fluides corporels. Ces procédés peuvent être utiles dans le diagnostic, la stadification ou autre caractérisation de diverses maladies. L'invention porte également sur des procédés pour identifier, diagnostiquer, stadifier ou autrement caractériser des cancers, en particulier des cancers gastro-intestinaux, tels que les cancers colorectaux, les cancers gastriques et les cancers de l'oesophage. Les procédés de l'invention portent, entre autres, sur l'isolement et l'analyse du composant d'ADN humain provenant d'échantillons de matières fécales et d'échantillons à base de sang.

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