Epigenetic markers for the identification of blood sub-cells...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2747312

The present invention relates to a method, in particular an in vitro method, for identifying CD3CD4 positive T lymphocytes of a mammal, wherein said method comprises analysing the methylation status of at least one CpG position in the CD3a/b/c/d/g genes, in particular their "upstream" regulatory regions, and in particular the promoter and other conserved regions of the gene cd3, wherein a demethylation of at least one CpG in the analyzed sample to at least 90% is indicative for memory and naive CD4 or/and memory and/or naïve T lymphocytes. Furthermore, the present invention is directed at the use of DNA-methylation analysis of the genes CD3a/b/c/d for the detection and quality assurance and control of T lymphocytes. Furthermore, the present invention relates to a kit for performing the above methods as well as respective uses thereof. In a preferred embodiment, the present invention furthermore provides an improved method for analysing the methylation status of at least one CpG position in the gene CD3, allowing for a precise analysis even from sub-optimal quality samples, such as non-freshly obtained blood or serum samples.

La présente invention concerne un procédé, en particulier un procédé in vitro, pour identifier des lymphocytes T CD3CD4 positifs d'un mammifère, ledit procédé comportant l'analyse de l'état de méthylation d'au moins une position CpG dans les gènes CD3a/b/c/d/g, en particulier leurs régions régulatrices « en amont » et, en particulier, le promoteur et d'autres régions conservées du gène cd3, une déméthylation d'au moins un CpG dans l'échantillon analysé à au moins 90 % indiquant des lymphocytes T CD4 mémoires et naïfs et/ou des lymphocytes T mémoires et/ou naïfs. En outre, la présente invention concerne l'utilisation d'une analyse de la méthylation de l'ADN des gènes CD3a/b/c/d pour la détection et l'assurance et le contrôle de la qualité des lymphocytes T. De plus, la présente invention concerne une trousse pour effectuer les procédés ci-dessus ainsi que les utilisations respectives de ceux-ci. Dans un mode de réalisation préféré, la présente invention concerne de plus un procédé amélioré pour l'analyse de l'état de méthylation d'au moins une position CpG dans le gène CD3, permettant une analyse précise même à partir d'échantillons de qualité sous-optimale, tels que des échantillons de sang ou de sérum qui n'ont pas été obtenus récemment.

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