G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/48 (2006.01)
Patent
CA 2549010
The accurate estimation of gene networks from gene expression measurements is a major challenge in the field of Bioinformatics. We present a general approach to reduce the search space to a biologically meaningful subspace and to find optimal solutions within the subspace in linear time by using inferential models constrained by biologically relevant information. We showed the effectiveness of this approach in application to yeast and Bacillus subtilis data. Also, we provide systems and storage media adapted to provide and store data and results of gene network relationships.
Selon cette invention, l'estimation précise de réseaux de gènes à partir de mesures d'expression génique constitue un défi majeur de la bioinformatique. Cette invention présente une approche générale visant à réduire l'espace de recherche à un sous-espace biologiquement significatif et à trouver des solutions optimales dans le sous-espace en temps linéaire à l'aide de modèles inférentiels limités par des informations biologiquement pertinentes. Cette invention permet de démontrer l'efficacité de cette approche lors de son application sur des données relatives à une levure et au Bacillus subtilis. Cette invention concerne par ailleurs des systèmes et des supports de stockage conçus pour fournir et stocker des données et des résultats de relations de réseaux de gènes.
Miyano Satoru
Ott Sascha
Gni Ltd.
Gni Usa
Gowling Lafleur Henderson Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1344847