C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) G01N 15/14 (2006.01)
Patent
CA 2232047
This invention provides methods of monitoring the expression levels of a multiplicity of genes. The methods involve hybridizing a nucleic acid sample to a high density array of oligonucleotide probes where the high density array contains oligonucleotide probes complementary to subsequences of target nucleic acids in the nucleic acid sample. In one embodiment, the method involves providing a pool of target nucleic acids comprising RNA transcripts of one or more target genes, or nucleic acids derived from the RNA transcripts, hybridizing said pool of nucleic acids to an array of oligonucleotide probes immobilized on surface, where the array comprising more than 100 different oligonucleotides and each different oligonucleotide is localized in a predetermined region of the surface, the density of the different oligonucleotides is greater than about 60 different oligonucleotides per 1 cm2, and the oligonucleotide probes are complementary to the RNA transcripts or nucleic acids derived from the RNA transcripts; and quantifying the hybridized nucleic acids in the array.
Cette invention concerne des procédés pour mesurer le niveau d'expression d'une multitude de gènes. Ces procédés consistent à hybrider un échantillon d'acide nucléique avec un système très dense de sondes oligonucléotidiques, ledit système contenant des sondes nucléotidiques complémentaires de sous-séquences d'acides nucléiques cibles de l'échantillon d'acide nucléique. Dans un mode de réalisation, le procédé consiste à produire un mélange d'acides nucléiques cibles comprenant des ARN de transcription d'un ou de plusieurs gènes cibles ou des acides nucléiques dérivés d'ARN de transcription, à hybrider le mélange des acides nucléiques avec un système de sondes oligonuclétidiques immobilisées sur une surface, le système comprenant plus de 100 oligonucléotides différents, chaque oligonucléotide différent se trouvant dans une région prédéterminée de la surface, la densité des différents oligonucléotides étant supérieure à environ 60 oligonucléotides différents par cm?2¿ et les sondes oligonucléotidiques étant complémentaires des ARN de transcription ou d'acides nucléiques dérivés des ARN de transcription et à quantifier les acides nucléiques hybridés avec le système.
Brown Eugene L.
Chee Mark
Fodor Stephen P. A.
Gingeras Thomas R.
Lipshutz Robert J.
Affymax Technologies N.v.
Affymetrix Inc.
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1548172