C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/31 (2006.01) A61K 38/16 (2006.01) C07K 14/31 (2006.01) C07K 16/12 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01) A61K 39/00 (2006.01)
Patent
CA 2310217
Isolated extracellular matrix-binding proteins, designated ClfB, SdrC, SdrD and SdrE, and their corresponding amino acid and nucleic acid sequences and motifs are described. The proteins, peptides, fragments thereof or antigenic portions thereof are useful for the prevention, inhibition, treatment and diagnosis of S. aureus infection and as scientific research tools. Further, antibodies or antibody fragments to the proteins, peptides, fragments thereof or antigenic portions thereof are also useful for the prevention, inhibition, treatment and diagnosis of S. aureus infection. In particular, the proteins or antibodies thereof may be administered to wounds or used to coat biomaterials to act as blocking agents to prevent or inhibit the binding of aureus to wounds or biomaterials. ClfB is a cell-wall associated protein having a predicted molecular weight of approximately 88 kDa and an apparent molecular weight of approximately 124 kDa, which binds both soluble and immobilized fibrinogen. ClfB binds both the alpha and beta chains of fibrinogen and acts as a clumping factor. SdrC, SdrD and SdrE are cell-wall associated proteins that exhibit cation-dependent ligand binding to the extracellular matrix. It has been discovered that in the A region of SdrC, SdrD, SdrE, ClfA and ClfB, there is a highly conserved amino acid sequence that can be used to derive a consensus motif of TYTFTDYVD.
L'invention concerne des protéines isolées liant la matrice extracellulaire, appelées ClfB, SdrC, SdrD et SdrE, et leurs séquences et motifs d'acides nucléiques et d'acides aminés correspondants. Les protéines, les peptides, leurs fragments ou leurs parties antigéniques sont utiles d'une part, à la prévention, l'inhibition, le traitement et le diagnostic d'infections à S. aureus et d'autre part, comme instruments de recherche scientifique. En outre, des anticorps ou des fragments d'anticorps contre les protéines, les peptides, leurs fragments ou leurs parties antigéniques sont également utiles à la prévention, l'inhibition, le traitement et le diagnostic d'infections à S. aureus. En particulier, on peut administrer les protéines ou leurs anticorps sur des lésions ou bien les utilisés pour enrober des biomatériaux destinés à agir comme agents bloquants pour prévenir ou inhiber la liaison de S. aureus à des lésions ou des biomatériaux. ClfB est une protéine associée à la paroi cellulaire, qui présente un poids moléculaire prédit d'environ 88 kDa et un poids moléculaire observé d'environ 124 kDa, et qui lie le fibrinogène aussi bien soluble qu'immobilisé. ClfB lie à la fois les chaînes alpha et bêta du fibrinogène et fait office de facteur d'agglutination. SdrC, SdrD et SdrE sont des protéines associées à la paroi cellulaire présentant une liaison par ligands dépendante des cations à la matrice extracellulaire. On a découvert qu'au niveau de la zone A de SdrC, SdrD, SdrE, ClfA et ClfB, se trouve une séquence d'acides aminés hautement conservée que l'on peut utiliser pour dériver un motif consensus de TYTFTDYVD.
Eidhin Deirdre Ni
Foster Timothy J.
Hook Magnus A. O.
Josefsson Elizabet
Patti Joseph M.
Bioresearch Ireland
Blake Cassels & Graydon Llp
Inhibitex Inc.
Texas A&m University
LandOfFree
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