C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/11 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01)
Patent
CA 2405960
Fluorescent DNA probes specific and flanking primer pairs are designed based on the sequence information found in the conserved terminal 3'-noncoding region of flavivirus, e.g. nucleotides 10653-10678 of dengue virus. Fluorogenic polymerase chain reaction employing these primers and probes produce results that permit specific flavivirus identification. The assays can be both quantitative and qualitative. Optimal assay conditions with zero background are disclosed which permit the detection of low levels of flavivirus from clinical specimens. Specifically, Dengue virus isolates from different geographic regions can be universally detected and identified by the disclosed fluorogenic RT-PCR assay. The fluorogenic RT-PCR assay readily detected viremia in sera collected from individuals ill with dengue fever.
Des sondes d'ADN spécifiques fluorescentes et des paires d'amorces flanquantes sont conçues sur la base des informations de séquence trouvées dans la région conservée terminale 3' non codante de flavivirus, par ex. les nucléotides 10653-10678 du virus de la dengue. L'amplification en chaîne par polymérase (PCR) fluorogène employant ces amorces et sondes produit des résultats qui permettent l'identification spécifique de flavivirus. Les analyses peuvent être tant qualitatives que quantitatives. Des conditions optimales d'analyse avec bruit de fond nul qui permettent la détection de faibles niveaux de flavivirus dans des spécimens cliniques sont également décrites. Spécifiquement, des virus de dengue isolés dans différentes régions géographiques peuvent être universellement détectés et identifiés par l'analyse fondée sur la RT-PCR fluorogène décrite. Ladite analyse RT-PCR fluorogène a permis de détecter facilement une virémie dans des sérums prélevés chez des patients atteints de la dengue.
Houng Huo-Shu H.
Kanesa-Thasan Niranjan
Fetherstonhaugh & Co.
The Government Of The United States As Represented By The Secretary Of The Army
LandOfFree
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