C - Chemistry – Metallurgy – 07 – D
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
D
C07D 231/56 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01)
Patent
CA 2356344
The invention relates to new fluorescent dyes of formula (I) which can be used in high throughput screening both, on the solid phase as well as in homogeneous solution. The new fluorescent dyes generically referred to as AIDA chemistry are suitable for various methods of solid phase and solution phase organic chemistry for synthesis of molecules to be investigated for therapeutic use in disease states. The molecules of therapeutic interest can be synthesized as fluorescent conjugates by two methods: (a) a solid support is loaded with a cleavable linker (acid-, base-, redox- or light sensitive) to which consecutively the fluorescent dye is attached. The dyes possess a second functionality, which serves as attachment point for spacer elements. The spacer bears a further functional group which us used as starting point of the synthesis of the molecules to be investigated; (b) the fluorescent dye can also be introduced as end-cap in the last synthesis step of a reaction sequence. The dyes described in the invention are chemically stable under a broad range of reaction conditions usually applied in solid phase and solution phase organic chemistry. The conjugates emit fluorescence in the visible and UV-spectral range on excitation at wavelengths of their absorption. These fluorescence properties allow for multiple applications in fluorescence based processes for the identification of inhibitors of molecular interactions and for the identification of molecules which bind to target macromolecules like peptides proteins, nucleic acids, carbohydrates etc. The fluorescence detection technologies used for monitoring binding of AIDA-conjugated compounds to macromolecules include conventional macroscopic techniques (ensemble averaging) which detect changes in fluorescence intensity, anisotropy(polarization), fluorescence resonance energy transfer, fluorescence lifetime, rotational correlation time as well as one- and two-dimensional single molecule spectroscopic techniques (SMS). Uses of the dye include solid phase and solution phase organic chemistry, low molecular weight compound labelling, peptide labelling, protein labelling, optical spectroscopy and fluorescence. Synthesis of functionalized dyes and of dye conjugates (on solid support and in solution) are disclosed.
La présente invention concerne de nouveaux colorants fluorescents de formule (I) qui peuvent être utilisés pour le criblage à haut rendement, aussi bien sur la phase solide que dans une solution homogène. Ces nouveaux colorants fluorescents regroupés sous le terme générique de chimie AIDA sont adaptés à divers procédés de chimie organique effectués sur la phase solide et la phase solution pour synthétiser des molécules devant être étudiées quant à leur utilisation thérapeutique dans divers états pathologiques. Les molécules présentant un intérêt thérapeutique peuvent être synthétisées sous forme de conjugués fluorescents au moyen de deux procédés : dans le premier procédé (a) un support solide est chargé avec un lieur clivable (lieur acide, base, oxydoréducteur ou sensible à la lumière) auquel est ensuite attaché le colorant fluorescent. Les colorants possèdent une deuxième fonctionnalité qui sert de point de fixation aux éléments séparateurs. Le séparateur porte un autre groupe fonctionnel qui sert de point de départ à la synthèse des molécules à étudier ; dans le deuxième procédé (b) le colorant fluorescent peut également être introduit en tant que chapeau terminal dans la dernière étape de synthèse d'une séquence de réaction. Les colorants décrits dans cette invention sont chimiquement stables sur une plage étendue de conditions de réaction habituellement appliquée en chimie organique en phase solide et en phase solution. Les conjugués émettent de la fluorescence dans la plage du spectre de la lumière visible et ultraviolette lorsqu'ils sont excités à des longueurs d'ondes correspondant à leur absorption. Ces propriétés de fluorescence permettent de les utiliser dans de nombreuses applications relatives à des procédés fondés sur la fluorescence destinés à identifier des inhibiteurs d'interactions moléculaires et à identifier des molécules qui se lient à des macromolécules cibles telles que des peptides, des protéines, des acides nucléiques, des glucides et autres. Les technologies de détection par fluorescence utilisées pour surveiller la liaison de conjugués-AIDA à des macromolécules comprennent des techniques macroscopiques classiques (moyennage de l'ensemble) qui détectent des variations de l'intensité de la fluorescence, de l'anisotropie (polarisation), du transfert d'énergie par résonance de fluorescence, de la durée de vie de la fluorescence, du temps de corrélation par rotation ainsi que des techniques spectroscopiques à molécule unique à une et deux dimensions. Les utilisations du colorant englobent la chimie organique de phase solide et de la phase solution, le marquage de composés de faible poids moléculaire, le marquage peptidique, le marquage protéique, la spectroscopie optique et la fluorescence. Des procédés de synthèse de colorants fonctionnalisés et de conjugués de colorants (sur support solide et en solution) sont décrits.
Auer Manfred
Gstach Hubert
Fetherstonhaugh & Co.
Novartis Ag
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1943666