Gels, methods and apparatus for identification and...

G - Physics – 01 – N

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G01N 27/447 (2006.01)

Patent

CA 2272092

The present invention provides computer-assisted methods and apparatus for identifying, selecting and characterizing molecules in a biological sample. A two-dimensional array is generated by separating biomolecules present in a complex mixture. A computer-readable profile is constructed representing the identity and relative abundance of a plurality of biomolecules detected by imaging the two-dimensional array. Computer-mediated comparison of profiles from multiple samples permits automated identification of subsets of biomolecules that satisfy pre-ordained criteria. Identified biomolecules can be automatically isolated from the two-dimensional array by a robotic device in accordance with computer-generated instructions. A supported gel suitable for electrophoresis is provided that is bonded to a solid support such that the gel has two-dimensional spatial stability and the solid support is substantially non-interfering with respect to detection of a label, such as a fluorescent label, associated with one or more biomolecules in the gel.

La présente invention concerne des méthodes assistées par ordinateur et un appareil d'identification, de sélection et de caractérisation de biomolécules dans un échantillon biologique. On obtient une configuration à deux dimensions par séparation des biomolécules présentes dans un mélange complexe. On établit un profil lisible par ordinateur représentant l'identité et l'abondance relative d'une pluralité de biomolécules détectées par imagerie de la configuration à deux dimensions. Une comparaison informatique des profils issus d'échantillons multiples permet une identification automatique des sous-ensembles de biomolécules répondant à des critères préétablis. Les biomolécules identifiées peuvent être automatiquement isolées de la configuration à deux dimensions à l'aide d'un robot, conformément à des instructions établies par ordinateur. L'invention concerne également un gel sur support adapté à l'électrophorèse et fixé sur un support solide de façon telle que le gel présente une stabilité spatiale dans les deux dimensions et que le support solide n'interfère pratiquement pas dans la détection d'un marqueur, tel qu'un marqueur fluorescent, associé à une ou plusieurs biomolécules présentes dans le gel.

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