Gene expression profiles to predict breast cancer outcomes

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2725760

Methods for classifying and for evaluating the prognosis of a subject having breast cancer are provided. The methods include prediction of breast cancer subtype using a supervised algorithm trained to stratify subjects on the basis of breast cancer intrinsic subtype. The prediction model is based on the gene expression profile of the intrinsic genes listed in Table 1. This prediction model can be used to accurately predict the intrinsic subtype of a subject diagnosed with or suspected of having breast cancer. Further provided are compositions and methods for predicting outcome or response to therapy of a subject diagnosed with or suspected of having breast cancer. These methods are useful for guiding or determining treatment options for a subject afflicted with breast cancer. Methods of the invention further include means for evaluating gene expression profiles, including microarrays and quantitative polymerase chain reaction assays, as well as kits comprising reagents for practicing the methods of the invention.

La présente invention concerne des procédés de classification et dévaluation du pronostic pour un sujet atteint dun cancer du sein. Les procédés incluent la prévision dun sous-type de cancer du sein au moyen dun algorithme contrôlé permettant de stratifier des sujets, sur la base dun sous-type intrinsèque de cancer du sein. Le modèle de prévision se base sur le profil dexpression génique des gènes intrinsèques répertoriés dans le tableau 1. Ce modèle de prévision peut être utilisé pour prévoir de manière précise le sous-type intrinsèque dun sujet ayant reçu un diagnostic de cancer du sein ou susceptible de souffrir dun tel cancer. Linvention porte en outre sur des compositions et des procédés permettant de prévoir lévolution ou la réaction à une thérapie dun sujet ayant reçu un diagnostic de cancer du sein ou susceptible de souffrir dun tel cancer. Ces procédés sont utiles dans lorientation ou la détermination des options de traitement pour un sujet souffrant dun cancer du sein. Des procédés de linvention incluent en outre des moyens permettant dévaluer des profils dexpression génique, y compris des puces à ADN et des dosages quantitatifs damplification en chaîne par polymérase, ainsi que des kits comprenant des réactifs permettant de mettre en pratique les procédés de linvention.

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