C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2722316
The present invention discloses a method of applying novel bioinformatics and computational methodologies to data generated by high-resolution genome-wide comparative genomic hybridization and gene expression profiling on CD138-sorted plasma cells from a cohort of 92 newly diagnosed multiple myeloma patients treated with high dose chemotherapy and stem cell rescue. The results revealed that gains the q arm and loss of the p arm of chromosome 1 were highly correlated with altered expression of resident genes in this chromosome, with these changes strongly correlated with 1) risk of death from disease progression, 2) a gene expression based proliferation index, and 3) a recently described gene expression-based high-risk index. Importantly, a strong correlation was found between copy number gains of 8q24, and increased expression of Argonate 2(AG02) a gene coding for a master regulator of microRNA expression and maturation, also being significantly correlated with outcome. These novel findings significantly improve the understanding of the genomic structure of multiple myeloma and its relationship to clinical outcome.
La présente invention concerne une méthode dapplication des nouvelles méthodologies de bioinformatique et de modélisation numérique aux données générées par lhybridation génomique comparative haute résolution sur tout le génome et lanalyse du profil dexpression génique sur des plasmocytes CD138 triés issus dune cohorte de 92 patients atteints dun myélome multiple nouvellement diagnostiqué traités par chimiothérapie à haute dose et par traitement de secours par cellules souches. Les résultats ont révélé que les gains du bras long (q) et la perte du bras court (p) du chromosome 1 étaient fortement corrélés avec lexpression modifiée des gènes résidents dans ce chromosome, ces changements étant fortement corrélés avec 1) un risque de décès en raison dune progression de la maladie, 2) un indice de prolifération basé sur lexpression génique, et 3) un indice de haut risque basé sur lexpression génique récemment décrit. De façon importante, une forte corrélation a été découverte entre les gains du nombre de copie de 8q24 et lexpression accrue dArgonate 2 (AG02), un gène codant pour un régulateur principal de lexpression et la maturation des micro-ARN, également fortement corrélée avec le résultat. Ces nouveaux résultats améliorent significativement la compréhension de la structure génomique du myélome multiple et de sa relation avec le résultat clinique.
Barlogie Bart
Burington Bart E.
Shaughnessy John D. Jr.
Zhan Fenghuang
Zhou Yiming
Borden Ladner Gervais Llp
The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1392204