Gene function inferring using gene expression data

Details Gene function inferring using gene expression data Gene function inferring using gene expression data

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2473816

Potential functions of one or more genes are inferred from gene expression measurements. A method involves assembling a distribution of expression level measurements for one or more genes. The method also involves calculating a significance value for each of the expression level measurements. The significance values determine which gene expression samples are classified as relevant and which are classified as irrelevant. The two sample classes are compared to each other to determine the non-overlapping parameters from the gene expression data between them. The non-overlapping parameters are used to indicate gene function of an unknown gene.

Des fonctions potentielles d'au moins un gène sont inférées à partir de mesures de l'expression génique. Une méthode consiste à assembler une distribution de mesures des niveaux d'expression pour au moins un gène. La méthode consiste également à calculer une valeur d'importance pour chacune des mesures du niveau d'expression. Les valeurs d'importance déterminent les échantillons d'expression génique qui sont classés comme étant pertinents et ceux qui sont classés comme étant non pertinents. Les deux classes d'échantillons sont comparées l'une à l'autre pour déterminer les paramètres ne se recoupant pas à partir des données d'expression génique de ces dernières. Les paramètres ne se recoupant pas sont utilisés pour indiquer la fonction génique d'un gène inconnu.

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