Gene identification method

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01)

Patent

CA 2269658

A method for the identification of genes that are essential for the maintenance of specific cell phenotypes is disclosed. The method includes the initial step of identifying a cell type with a phenotype of interest. Gene inactivation is performed on an aliquot of cells of the cell type of interest. Positive selection is then performed to an aliquot of the cell culture to which gene inactivation has been applied. Cells which continue to maintain the phenotype following gene inactivation have not had the gene of interest inactivated whereas cells in which genes necessary for maintaining the phenotype have been inactivated have been lost. Utilizing subtraction analysis between treated and untreated aliquots the gene in the cells which has been inactivated that affects the phenotype of interest is identified. Genes that are identified by the method are also disclosed as well as antibodies directed against the gene product of the identified genes. Further a customized kit for the practice of the gene identification method is also disclosed.

La présente invention concerne un procédé permettant d'identifier des gènes essentiels au maintien de certains phénotypes cellulaires spécifiques. Ce procédé consiste, en un premier temps, à identifier un type de cellule présentant un phénotype d'intérêt. On soumet ensuite une aliquote de cellules du type de la cellule d'intérêt à une inactivation génique, et on effectue une sélection positive sur une aliquote de la culture cellulaire qui a été soumise à l'inactivation génique. Les cellules qui continuent de présenter le phénotype après l'inactivation génique sont des cellules dans lesquelles le gène d'intérêt n'a pas été inactivé, tandis que les cellules dans lesquelles les gènes nécessaires au maintien du phénotype ont été inactivés sont perdues. Au moyen d'une analyse par soustraction entre les aliquotes traitées et les aliquotes non traitées, on identifie dans les cellules le gène qui a été inactivé et qui influence le phénotype. On décrit également des gènes identifiés selon le procédé de la présente invention, ainsi que des anticorps dirigés contre le produit génique des gènes identifiés. On décrit en outre un matériel personnalisé permettant de mettre en pratique le procédé d'identification génique de la présente invention.

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