C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) G06F 17/00 (2006.01)
Patent
CA 2603205
A method and system for synthesizing one or more pieces of DNA with desired sequences using pooled DNA, the method comprising a hierarchical division phase and a hierarchical assembly phase. In the division phase, the sequences of one or more pieces of DNA with desired nucleic acid sequences are recursively: divided into partially overlapping resulting pieces of DNA, and the resulting pieces of DNA assigned to a plurality of pools except after the after the final division step, wherein overlapping, adjacent resulting pieces of DNA are assigned to different pools. In the assembly phase, pools of oligonucleotides are obtained corresponding to the pools of the resulting pieces of DNA, and one or more pieces of DNA with desired sequences are assembled by overlap extension in the reverse order of the hierarchical division. Embodiments of the method combine the advantages of hierarchical assembly with the advantages of pooled oligonucleotides.
L'invention concerne un procédé et un système permettant de synthétiser au moins un morceau d'ADN avec des séquences désirées au moyen d'ADN groupés, ce procédé comprenant une phase de division hiérarchique et une phase d'assemblage hiérarchique. Dans la phase de division, les séquences d'au moins un morceau d'ADN avec des séquences d'acides nucléiques désirées sont récursivement: divisées en morceaux d'ADN résultants se chevauchant partiellement, les morceaux d'ADN résultants étant attribués à une pluralité de groupes, sauf après l'étape de division finale, des morceaux d'ADN résultants adjacents se chevauchant étant attribués à différents groupes. Dans la phase d'assemblage, des groupes d'oligonucléotides sont obtenus, ces groupes correspondant aux groupes des morceaux d'ADN résultants, et au moins un morceau d'ADN avec des séquences désirées est assemblé par extension de chevauchement dans l'ordre inverse de la division hiérarchique. Des modes de réalisation de ce procédé combinent les avantages de l'assemblage hiérarchique avec les avantages d'oligonucléotides groupés.
Colman Richard
Hatfield G. Wesley
Hung She-Pin
Lathrop Richard H.
Robic
The Regents Of University Of California
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1997708