Generation and use of isotopic patterns in mass spectral...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/00 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01)

Patent

CA 2701476

A method for assaying phenotypic similarity or dissimilarity between organisms is disclosed in which a composite sample of admixed first and second samples is provided. The first, standard sample contains average concentrations of compounds of molecular mass less than about 1000 AMU present in the organism species. The second, assay sample contains compounds of having a similar molecular mass present in the organism whose phenotype is to be assayed. The constituents of both samples are (i) in a liquid medium and (ii) each compound of a sample has the same, first and second respective amounts of first and second stable isotopes of a first atom. The composite sample is mass spectroscopically analyzed for analytes, with the ratio of first to second isotope being determined for each analyte, along with a composite sample median ratio. The ratios for each analyte are compared to the median, with outlying ratios indicating dissimilarity.

La présente invention concerne un procédé d'évaluation des similitudes ou des différences phénotypiques entre des organismes, procédé utilisant un échantillon composite constitué d'un mélange d'un premier et d'un second échantillon. Le premier échantillon, étalon, contient des concentrations moyennes en composés de masse moléculaire inférieure à environ 1 000 uma, caractéristiques de l'espèce à laquelle appartient l'organisme. Le second échantillon, test, contient des composés de masse moléculaire similaire présents dans l'organisme dont le phénotype doit être étudié. Les constituants des deux échantillons sont (i) dans un milieu liquide et (ii) chaque composé d'un échantillon présente les mêmes première et seconde teneurs respectivement en un premier et en un second isotope stables d'un premier atome. L'échantillon composite est analysé par spectroscopie de masse à la recherche d'analytes, le rapport entre les premier et second isotopes étant déterminé pour chaque analyte, en même temps qu'un rapport médian pour l'échantillon composite. Les rapports correspondant à chaque analyte sont comparés au rapport médian, des rapports trop excentriques étant révélateurs d'une différence.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-1391884

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