Genetic analysis by sequence-specific sorting

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2555377

The invention provides methods for sorting polynucleotides from a population based on predetermined sequence characteristics. In one aspect, the method of the invention is carried out by extending a primer annealed polynucleotides having predetermined sequence characteristics to incorporate a predetermined terminator having a capture moiety, capturing polynucleotides having extended primers by a capture agent that specifically binds to the capture moiety, and melting the captured polynucleotides from the extended primers to form a subpopulation of polynucleotides having the predetermined sequence characteristics. In another aspect, the method of the invention is carried out on a population of tagged polynucleotides so that after a subpopulation is selected, the members of the subpopulation may be simultaneously analyzed using the unique tags on the polynucleotides to convey analytical information to a hybridization array for a readout.

L'invention concerne des procédés permettant de trier des polynucléotides à partir d'une population en fonction de caractéristiques de séquences prédéterminées. Dans un mode de réalisation, le procédé de l'invention consiste à étendre une amorce ayant subi un annelage à des polynucléotides possédant des caractéristiques de séquences prédéterminées afin d'incorporer un terminateur prédéterminé comprenant une fraction de capture; à capturer des polynucléotides comprenant des amorces étendues au moyen d'un agent de capture qui se lie spécifiquement à la fraction de capture; et à faire fondre les polynucléotides capturés à partir des amorces étendues afin de former une sous-population de polynucléotides possédant les caractéristiques des séquences prédéterminées. Dans un autre mode de réalisation, le procédé de l'invention est mis en oeuvre sur une population de polynucléotides ciblés de sorte qu'une fois qu'une sous-population est sélectionnée, les membres de cette sous-population peuvent simultanément être analysés à l'aide des étiquettes uniques sur les polynucléotides afin de transférer des informations analytiques vers un réseau d'hybridation pour lecture.

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