Genomic assay

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2581087

A method of detecting a nucleic acid sequence in a genomic sample, includes: providing the genomic sample containing a target nucleic acid sequence of a duplex nucleic acid; providing, a probe containing a probe nucleic acid sequence; providing a hybridization mixture containing the genomic sample, the probe, a hybridization promoting agent and labels; incubating the hybridization mixture; irradiating the incubated mixture with radiation effective to stimulate at least some of the labels to emit energy; and detecting from a fluorescent signal whether the probe perfectly matches the target nucleic acid sequence, wherein the detecting is completed within sixty minutes of the hybridization mixture providing, and the method is conducted without denaturing and without PCR amplifying the duplex nucleic acid. A kit for practicing the method includes the probe, the hybridization promoting agent, and labels.

L'invention concerne une méthode permettant de détecter une séquence d'acide nucléique dans un échantillon génomique. Cette méthode consiste : à préparer l'échantillon génomique contenant une séquence d'acide nucléique cible d'un acide nucléique duplex ; à préparer une sonde contenant une séquence d'acide nucléique de sonde ; à préparer un mélange d'hybridation contenant l'échantillon génomique, la sonde, un agent stimulant l'hybridation et des étiquettes ; à incuber le mélange d'hybridation ; à irradier le mélange incubé à l'aide d'un rayonnement qui stimule efficacement au moins certaines des étiquettes de façon qu'elles émettent de l'énergie ; et à détecter à partir d'un signal fluorescent si la sonde est parfaitement appariée à la séquence d'acide nucléique cible, la détection étant réalisée pendant les soixante minutes suivant la préparation du mélange d'hybridation. La méthode est mise en oeuvre sans dénaturation et sans amplification PCR de l'acide nucléique duplex. Une trousse permettant de mettre en oeuvre ladite méthode comprend la sonde, l'agent stimulant l'hybridation et les étiquettes.

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