Genotyping of multiple loci with pcr for different loci...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2566860

Disclosed is a method of performing simulltaneous PCR amplification of several designated different loci in a sample each including a different target subsequence, using a set of pairs of forward and reverse primers, wherein the pairs are complementary to target subsequences, where different primer pairs are in different reaction chambers and the sample is also present in the reaction chambers, and wherein different primer pairs have different sequences. Different reaction chambers are provided different annealing temperatures, preferably at the same time, such that the annealing temperatures selected enhance annealing conditions for the primer pairs and the target subsequences within the reaction chambers. The method allows PCR to proceed more quickly, which is important to increase throughput in a multiplexed assay, and can be particularly important for HLA-typing in a transplantation setting.

L'invention concerne une méthode qui permet d'effectuer simultanément une amplification PCR de plusieurs différents sites désignés dans un prélèvement, chaque site comprenant une sous-séquence cible, au moyen d'un ensemble de paire d'amorces avant et inverse, lesdites paires étant complémentaires de sous-séquences cibles. Différentes paires d'amorces sont palcées dans différentes chambres de réaction, et le prélèvement est également présent dans les chambres de réaction, différentes paires d'amorces comportant différentes séquences. Différentes chambres de réaction sont chauffées à différentes températures de recuit, de préférence en même temps, si bien que les températures de recuit choisies améliorent les conditions de recuit pour les paires d'amorces et les sous-séquences cibles à l'intérieur des chambres de réaction. La méthode permet d'accélérer la PCR, ce qui est important pour augmenter le rendement dans un dosage muiltiplexé, et particulièrement important pour le groupage HLA dans un environnement de greffe.

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