C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
Patent
CA 2343076
The present invention provides a method for generating a representation of the extent of relatedness between at least two classes of cells. The invention also provides a method for generating a representation of the correlation between a first class of cells and a second class of cells. The correlation reflects a change in the nature and amount of nucleic acids present in the classes. In these methods, the cells in each class are chosen from among cells of a given cell type, cells from a given tissue, and cells from a given organ. The methods establish similarities or differences between the classes by defining a plurality of pairs of nucleotide subsequences, each pair consisting of a first subsequence and a second subsequence, and, in the nucleic acid of each class of cells, determining the presence of a fragment with the first subsequence at one end and the second subsequence at another end and having a length separated by the first and second subsequences, as well as a quantitation of the extent to which each fragment is present. The methods then determine the extent of relatedness reflecting the similarities or differences among the classes. The invention further provides display means displaying a representation of the extent of relatedness between the classes of cells, and displaying a representation of the correlation between the first class of cells and the second class of cells. Additionally, the invention provides a representation of the extent of relatedness between the classes of cells, and representation of the correlation between the first class of cells and the second class of cells.
L'invention concerne une technique permettant de créer une représentation du degré de parenté entre au moins deux classes de cellules. L'invention a trait également à une technique permettant de créer une représentation de la corrélation entre une première et seconde classes de cellules. La corrélation représente un changement dans la nature et la quantité d'acides nucléiques présents dans les classes. Ces techniques consistent à sélectionner les cellules de chaque classe parmi des cellules d'un type de cellule donnée, des cellules d'un tissu donné, et des cellules d'un organe donné. Ces techniques permettent d'établir des similitudes ou des différences entre les classes en définissant plusieurs paires de sous-séquences de nucléotides, chaque paire comprenant une première et seconde sous-séquences. Elles consistent également à déterminer dans l'acide nucléique de chaque classe de cellules, la présence d'un fragment comportant la première sous-séquence à une extrémité et la seconde sous-séquence à une autre extrémité, fragment qui possède une longueur séparant la première et la seconde sous-séquences, et à déterminer dans quelle mesure le fragment est présent. Ces techniques permettent de déterminer le degré de parenté reflétant les similitudes ou les différences parmi les classes. Par ailleurs, l'invention concerne un dispositif d'affichage affichant une représentation du degré de parenté entre les classes de cellules, ainsi qu'une représentation de la corrélation entre la première et seconde classes de cellules. De plus, l'invention porte sur une représentation du degré de parenté entre les classes de cellules, et une représentation de la corrélation entre la première et seconde classes de cellules.
Curagen Corporation
Everitt Peter R.
LandOfFree
Geometrical and hierarchical classification based on gene... does not yet have a rating. At this time, there are no reviews or comments for this patent.
If you have personal experience with Geometrical and hierarchical classification based on gene..., we encourage you to share that experience with our LandOfFree.com community. Your opinion is very important and Geometrical and hierarchical classification based on gene... will most certainly appreciate the feedback.
Profile ID: LFCA-PAI-O-1525239