Glycosylase mediated detection of nucleotide sequences at...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2226542

A method for rapidly detecting the presence or absence of a particular nucleic acid sequence at a candidate locus in a target nucleic acid sample comprises the steps of: i) introducing a modified base which is a substrate for a DNA glycosylase into said candidate locus at one or more preselected positions; ii) excising the modified base by means of said DNA glycosylase so as to generate an abasic site; iii) cleaving phosphate linkages at abasic sites generated in step ii); and iv) analysing the cleavage products of step iii) so as to identify in said target nucleic acid sequence the presence or absence of said particular nucleic acid sequence at said candidate locus. The method has particular application for detecting specific mutations in a DNA sample, including the detection of multiple known mutations in DNA. Large throughput of sample can be achieved rapidly and easily.

Procédé de détection rapide de la présence ou de l'absence d'une séquence d'acide nucléique particulière sur un locus potentiel dans un échantillon d'acide nucléique cible, ce procédé consistant à: i) introduire une base modifiée qui est un substrat destiné à un ADN glycosylase dans ce locus potentiel au niveau d'une ou de plusieurs positions présélectionnées; ii) exciser la base modifiée au moyen de l'ADN glycosylase de façon à générer un site abasique; iii) cliver des liaisons phosphate sur les sites abasiques générés à l'étape ii); et iv) analyser les produits de clivage de l'étape iii) de façon à identifier dans cette séquence d'acide nucléique cible la présence ou l'absence de cette séquence d'acide nucléique particulière sur ce locus potentiel. Ce procédé peut être notamment appliqué dans la détection de mutations spécifiques dans un échantillon d'ADN, y compris dans la détection de multiples mutations connues dans l'ADN. Il est possible ainsi de traiter rapidement et facilement une grande quantité d'échantillons.

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