C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) B01J 19/00 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01)
Patent
CA 2444467
The invention provides improved methods and devices for the detection and identification in a sample of one or more target molecules which bind to probe molecules, particularly to nucleic acid probe molecules. The improved method is based on contacting the sample with a surface that is coated with one or more gradients of probe molecules, particularly nucleic acid or nucleic acid analog probe molecules that serve to bind target molecules in the sample, particularly nucleic acids having sequences that are complementary or partially complementary to one or more probe molecules. A probe gradient generated on the surface is formed by the variation of a physical, structural or functional property of the probes on the surface. The gradients is generated, e.g., by varying density of probe molecules bound to the surface, by varying probe sequence length, by varying probe sequence, by varying probe sequence type, by varying the orientational structure of probes, and by varying the concentration of label associated with probes. Determination of the location, speed and/or extent of hybridisation of a nucleic acid on such a gradient surface is useful to identify target molecules bound to probes and/or to quantitatively measure the amount of the target in a sample. Hybridisation of target molecules to a gradient of nucleic acid probe can be examined as a function of time and/or hybridisation conditions (e.g., temperature, salt concentration, etc.) The method and devices of this invention employ gradient surfaces to bind to one or more target molecules, particularly nucleic acids (or target sequences) in a sample, detecting their presence in the sample and quantitating the amount of one or more of such targets in a sample.
L'invention concerne des procédés et des dispositifs perfectionnés pour la détection et l'identification dans un échantillon d'une ou de plusieurs molécules cibles se liant en molécules sondes, en particulier en molécules sondes d'acide nucléique. Le procédé perfectionné consiste à mettre l'échantillon en contact avec une surface couverte d'un ou de plusieurs gradients de molécules sondes, en particulier de l'acide nucléique ou de molécules sondes analogues à l'acide nucléique, ces molécules servant à lier des molécules cibles dans l'échantillon, notamment des acides nucléiques ayant des séquences complémentaires ou partiellement complémentaires à une ou plusieurs molécules sondes. Un gradient sonde généré sur la surface est créé par la variation d'une propriété fonctionnelle, structurelle ou physique des sondes sur la surface. Le gradient est généré par modification, par ex., de la densité des molécules sondes liées à la surface, de la longueur de séquence sonde, de la séquence sonde, du type de séquence sonde, de la structure d'orientation des sondes, de la concentration de marqueur associé aux sondes. La détermination de l'emplacement, la vitesse et/ou l'étendue de l'hybridation d'un acide nucléique sur une telle surface de gradient sont utiles pour identifier les molécules cibles liées aux sondes et/ou pour mesurer la quantité d'une cible dans un échantillon. L'hybridation de molécules cibles avec un gradient de sonde d'acide nucléique peut être examinée comme une fonction des conditions de temps et/ou d'hybridation (par ex., température, concentration de sel, etc.). Les procédés et des dispositifs selon l'invention mettent en oeuvre des surfaces de gradient pour se lier à une ou plusieurs molécules cibles, en particulier des acides nucléiques (ou des séquences cibles) dans un échantillon, en détectant leur présence dans l'échantillon et en quantifiant la ou les cibles de ce type dans un échantillon.
Krull Ulrich J.
Mckay-Carey & Company
LandOfFree
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